Grantové projekty na katedře genetiky a mikrobiologie
Domácí granty
Výzkumné projekty řešené na katedře byly již od počátku zavedení grantového systému v ČR podporovány mnoha domácími granty a katedra v tomto trendu úspěšně pokračuje i nadále. Jedná se především o řadu projektů Grantové agentury ČR, Technologické agentury ČR i Grantové agentury Akademie věd ČR (v minulosti - než byla činnost této agentury ukončena), a dále také o projekty řešené v rámci různých programů vypisovaných Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy ČR (programy 7F - Finanční mechanismy EHP/Norsko, COST CZ (2011-2017), EUPRO, INGO, KONTAKT, Posílení výzkumu na vysokých školách, Prezentace výsledků výzkumu a vývoje, Program rozvoje vzdělávání, Projekty velkých infrastruktur pro VaVaI (2010-2022), Operační program výzkum, vývoj, vzdělávání (2014-2020), INTER-EXCELLENCE (2016-2024), INTER-EXCELLENCE II (2021-2029)). Členové katedry byli rovněž nositeli několika projektů Fondu rozvoje vysokých škol MŠMT.
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR (MŠMT) je poskytovatelem řady dalších zdrojů a organizátorem různých programů většího rozsahu, z nichž je financován vysokoškolský výzkum v ČR a do nichž se členové katedry intenzivně zapojují.
Jedním z typů financování vědy a výzkumu v letech 2003-2013 byly tzv. výzkumné záměry MŠMT. V minulosti byla katedra hlavním koordinátorem výzkumného záměru Regulace a signalizace v živých systémech a její členové se podíleli na výzkumu v rámci výzkumných záměrů Signalizace a molekulární mechanismy buněčné odpovědi, Ekologické procesy v evoluci modelových skupin organismů a Molekulární základy dětských nádorových onemocnění a léčebné aplikace.
V letech 2005-2011 vyhlásilo MŠMT program Centra základního výzkumu LC za účelem zvýšení konkurenceschopnosti špičkových českých vědeckých pracovišť v Evropském výzkumném prostoru a přispění k výchově mladých odborníků. Členové katedry byli zapojeni do pěti projektů tohoto typu (Centrum funkční organizace buňky, Centrum molekulární biologie a fyziologie společenstev kvasinek, Centrum environmentální mikrobiologie, Fluorescenční mikroskopie v biologickém a lékařském výzkumu, Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů) a dále do Výzkumného centra typu 1M v rámci Národního programu výzkumu NPV I (Nová antivirotika a antineoplastika).
V letech 2016-2020 MŠMT vyhlásilo na zajištění udržitelnosti projektů center výzkumu, experimentálního vývoje a inovací, vybudovaných realizací projektů operačních programů strukturálních fondů tzv. Národní program udržitelnosti II, do něhož byla rovněž zapojena řada členů katedry pracujících v BIOCEVu. Stejně tak byli různí členové katedry zapojeni do Operačního programu Výzkum, vývoj a vzdělávání (OP VVV), což byl další program zajišťovaný MŠMT, v jehož rámci bylo možné v programovém období 2014 - 2023 čerpat finanční prostředky z Evropských strukturálních a investičních fondů.
Operační program Jan Amos Komenský (OP JAK), probíhající letech 2021-2027 a spolufinancovaný Evropskou unií, je důležitým zdrojem financování výzkumu v současné době a jako spoluřešitelé jsou do něj zapojeny dvě výzkumné skupiny katedry (Laboratoř biologie kvasinkových kolonií do projektu LasApp a Laboratoř biochemie RNA do projektu RNA4T: RNA pro terapii).
Kromě toho je pět katedrových skupin (Laboratoř molekulární a nádorové virologie, Laboratoř imunoterapie, Laboratoř biochemie RNA, Laboratoř proteáz a Laboratoř virologie) zapojeno i do programu EXCELES v rámci Národního plánu obnovy (NPO) v gesci MŠMT, což je rovněž program spolufinancovaný Evropskou unií. Z tohoto projektu je částečně hrazen výzkum v rámci celostátního projektu Národního institutu virologie a bakteriologie.
Další projekty řešené na katedře jsou nebo byly podporovány Ministerstvem zdravotnictví ČR (programy Výzkum a vývoj v oblasti Onkologie, Resortní program výzkumu a vývoje Ministerstva zdravotnictví, Resortní program výzkumu a vývoje - MZ II na léta 2008-2011, Resortní program výzkumu a vývoje Ministerstva zdravotnictví III (2010-2015), Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu a vývoje na léta 2015-2022), Ministerstvem zemědělství ČR (Program II, Program aplikovaného výzkumu Ministerstva zemědělství na období 2017-2025 (ZEMĚ)), Ministerstvem průmyslu a obchodu ČR (TRIO (2016-2021)) či Ministerstvem vnitra ČR (programy Nejzávažnější bezpečnostní rizika, Strategická podpora rozvoje bezpečnostního výzkumu ČR 2019-2025 (IMPAKT 1) a Bezpečnostní výzkum České republiky 2015-2022).
V rámci systému financování vědy na Univerzitě Karlově se členové katedry intenzivně zapojují do systému Univerzitních výzkumných center (UNCE), projektů Specifického vysokoškolského výzkumu (SVV) a dále do Programů rozvoje vědních oblastí na Univerzitě Karlově (PRVOUK), nahrazených od r. 2017 programy PROGRES, jakož i do programu COOPERATIO, začínajícího v r. 2022. Mgr. Klára Grantz Šašková, Ph.D. z Laboratoře proteáz získala v letech 2021-2023 grantovou podporu v rámci soutěže UK Primus, jejímž cílem je podpořit mladé špičkové pracovníky při zakládání a rozvoji nových vědeckých skupin a laboratoří. Především doktorandi katedry jsou rovněž velmi úspěšní v získávání grantů podporovaných Grantovou agenturou Univerzity Karlovy v Praze.
Zahraniční granty
Výzkumné týmy katedry jsou však v získávání grantových projektů úspěšné nejen na poli domácím, ale i v zahraniční konkurenci.
Prof. RNDr. Zdeně Palkové, CSc. z Laboratoře biologie kvasinkových kolonií byly uděleny dva granty americké nadace Howard Hughes Medical Institute ("Studies of Signals Involved in the Development of Multicellular Structures - Yeast Colonies" a "Multicellular Yeast Communities: Signalling, Differentiation and Long-Term Survival"). Byla rovněž hlavní řešitelkou projektu Česko-norského výzkumného programu (EEA grants/Norway grants) s názvem "3D yeast colony genomics: A model for cancer progression and development of drug resistance in biofilms".
Doc. RNDr. Ruth Tachezy, Ph.D. z Laboratoře molekulární a nádorové virologie, byla v letech 2017-2019 jednou z hlavních řešitelek projektu "Metagenomic analysis of the virome of the honeybee (Apis mellifera) in the Czech Republic" v rámci konsorcia Central Europe Leuven Strategic Alliance (CELSA), a v letech 2021-2022 spoluřešitelkou v rámci projektu ECDC HERA "Posílení národní infrastruktury s cílem zvýšení kapacity celogenomové sekvenace (whole genome sequencing – WGS) a “diskriminačních” RT PCR s ohledem na národní připravenost na pandemii Covid-19 v ČR", financovaného European Centre for Disease Prevention and Control. V současnosti je zapojena do výzkumu v rámci programu Horizon 2020 DURABLE (2023-2026).
Laboratoř virologie byla rovněž řešitelským pracovištěm projektu nadace Howard Hughes Medical Institute "Polyoma Late Antigens: Interactions, Functions and Utilisation" a spoluřešitelským pracovištěm projektu Biotechnologického programu Evropské komise "Polyomavirus Pseudocapsids as Vectors. Applications for Genetic and Immunological Therapeutic Purposes of Modified VP1 Pseudocapsids", pod vedením doc. RNDr. Jitky Forstové, CSc. Členové této Laboratoře se v současnosti spolupodílejí svým výzkumem i na grantu ERC CZ získaném doc. Veronikou Novákovou z Farmaceutické fakulty UK "Chytré fotosenzitizéry: Vysoce-účinné, aktivovatelné a s cílenou distribucí pomocí aptameru (SPs-HEAT)"
Laboratoř fyziologie bakterií se v minulosti pod vedením doc. RNDr. Iva Konopáska, CSc., zapojila do řešení mezinárodního projektu v rámci Pátého rámcového programu Evropské unie "Detoxified Adenylate Cyclase Toxin: A Major Improvement for the Development of Safe, Efficient and Multipurpose Vaccines".
Laboratoř cytogenetiky pavoukovců vedená doc. RNDr. Jiřím Králem, Ph.D., se podílela na výzkumném projektu podporovaném US National Science Foundation "Global Survey and Inventory of Solifugae".
S přehledem grantových projektů za posledních 10 let řešených na katedře genetiky a mikrobiologie se můžete seznámit v následujících grafech:
