Uchazeč o navazující magisterské studium volí z 5 oblastí studia: biologie, chemie, geografie, geologie a životního prostředí.
Antropologie a genetika člověka
Bioinformatika
Botanika (vyučovaný i v angličtině )
Buněčná biologie
Ekologie (vyučovaný i v angličtině )
Evoluční biologie
Experimentální biologie rostlin
Fyziologie živočichů
Genetika, molekulární biologie a virologie
Imunologie (vyučovaný i v angličtině )
Mikrobiologie
Parazitologie (vyučovaný i v angličtině )
Protistologie
Reprodukční a vývojová biologie
Teoretická a evoluční biologie
Učitelství biologie pro střední školy (jednoobor i dvouobor)
Zoologie
Analytická chemie
Anorganická chemie
Biochemie
Chemie a fyzika materiálů
Fyzikální chemie
Klinická a toxikologická analýza
Makromolekulární chemie
Medicinální chemie
Organická chemie
Učitelství chemie pro střední školy (jednoobor i dvouobor)
Demografie (vyučovaný i v angličtině )
Fyzická geografie a geoekologie
Geoinformatika, kartografie a dálkový průzkum Země
Globální migrační a rozvojová studia
Hydrologie a hydrogeologie
Krajina a společnost
Politická a regionální geografie
Sociální epidemiologie
Sociální geografie a regionální rozvoj
Učitelství geografie pro střední školy (jednoobor i dvouobor)
Aplikovaná geologie
Geobiologie
Geologie (vyučovaný i v angličtině )
Učitelství geologie pro střední školy (dvouobor)
Ochrana životního prostředí
(samostatně a nebo v kombinaci s druhou aprobací)
Učitelství biologie pro střední školy
Učitelství chemie pro střední školy
Učitelství geografie pro střední školy
Učitelství geologie pro střední školy