Výzkum
Naše výzkumná skupina se zabývá procesy buněčného rozpoznávání, tj. jak buňky imunitního systému, například NK buňky, rozeznávají pomocí receptorů exprimovaných na svém povrchu jiné cílové proteiny, exprimované na povrchu buněk zdravých či naopak buněk nádorových, viry infikovaných nebo jinak stresovaných. Zabýváme se jednak vztahem struktura-funkce, a to pomocí celé škály moderních metod výzkumu struktury a vlastností proteinů a jejich interakcí, a jednak tím, jak získané poznatky převést do praktické roviny, mj. návrhem umělých proteinových konstruktů, které by napomohly buňkám imunitního systému v lepším rozeznávání cílových buněk a jejich eliminaci. Pro novinky a více informací navštivte prosím samostatný web naší výzkumné skupiny.
Laboratoř strukturní biochemie imunitního rozpoznávání
Cíle:
Strukturní výzkum komplexů NK buněčných receptorů s jejich ligandy
- Používané metody:
- Rekombinantní exprese proteinů v lidské buněčné linii HEK293
- Biofyzikální charakterizace proteinů a jejich interakcí (AUC, ITC, MST, DLS, DSF, SPR)
- Proteinová krystalografie, strukturní hmotnostní spektrometrie, SAXS, NMR
Výzkum uspořádání NK buněčných receptorů na povrchu živé buňky
- Super-rezoluční mikroskopie, fluorescenční mikroskopie, průtoková cytometrie, lokalizační mikroskopie jednotlivých molekul (SMLM)
Příprava fúzních konstruktů nanoprotilátek s ligandy aktivačních receptorů NK buněk a testování jejich biologické aktivity
- Izolace NK buněk z krve zdravých dárců
- Cytotoxické testy NK buněk vůči nádorovým buněčným liniím
Příprava fúzních konstruktů s cytokiny či růstovými faktory
- Exprese, purifikace a studium vlastností fúzních proteinů obsahujících proteinové hormony či cytokiny
Kontakt
Katedra biochemie Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy
Hlavova 2030/8, 128 00 Praha 2, 1. patro, dveře 204
tel: +420 221 951 272
e-mail: ondrej.vanek@natur.cuni.cz
Lidé
Vedoucí skupiny: Ondřej Vaněk
Vědečtí pracovníci: Jan Bláha (v současnosti zahraniční stáž v EMBL Hamburg), Barbora Kalousková (v současnosti zahraniční stáž na TU Wien), Ondřej Skořepa (v současnosti zahraniční stáž v MPI Biochemie Mnichov)
Ph.D. studenti: Celeste de Sousa Santos Abreu, Shiva Nejadebrahim
Mgr. studenti: Nadezda Bragina, Anastassiya Rudenko, Zuzana Urbanová, Jakub Jeníček, Tereza Cibiková
Bc. studenti: Daniel Hoffman, Andrea Janoušková, Samuel Janík
Projekty
GA ČR, 15-15181S Využití rozpustných forem receptorů NK buněk a jejich ligandů pro přípravu nových protinádorových imunoterapeutik (2015 – 2017) - O. Vaněk
GA UK, 161216 Využití strukturního popisu interakce lidského lymfocytárního komplexu NKR-P1 a LLT1 pro vývoj fúzních imunoaktivních terapeutik (2016 – 2018) - J. Bláha / B. Kalousková
GA UK, 927916 Vliv glykosylace a oligomerizace NKp30 na tvorbu jeho komplexů – klíčové vlastnosti pro aktivaci NK buněk (2016 – 2018) - S. Pažický / O. Skořepa
MŠMT ČR, program INTER-COST, LTC17065 Využití kombinace molekulárních biofyzikálních přístupů pro funkční studie lidských receptorů NK buněk a tvorby jejich komplexů s nádorovými ligandy (2017 – 2020) - O. Vaněk
GA ČR, 18-10687S Nové ligandy pro staré receptory lidských NK buněk: struktura, uspořádání v imunologické synapsi a potenciál pro terapii (2018 – 2020) - O. Vaněk
GA UK, 1740318 Využití aktivačních ligandů a nanoprotilátek pro cílenou stimulaci cytotoxicity NK buněk (2018 – 2019) - D. Cmunt
GA UK, 1378219 Kvartérní struktura vybraných lidských NK buněčných receptorů pohledem super-rezoluční mikroskopie: Jaká je biologická realita krystalových struktur? (2019 – 2021) - B. Kalousková
GA ČR, 20-13029S Vývoj klinicky relevantních IL-2 imunoterapeutik pro léčbu nádorů (2020 – 2022) - O. Vaněk (spoluřešitel)
GA UK, 1436020 Strukturní biochemie NK buněčných komplexů NKp44:PCNA a NKp46:Epa1, a využití Epa1 pro stimulaci NK buněk (2020 – 2022) - J. Houserová
GA UK, 1436220 Aktivace NK buněčné protinádorové odpovědi pomocí bispecifických fúzních proteinů s nanoprotilátkami (2020 – 2022) - C. Abreu
MŠMT ČR, program INTER-COST, LTC20078 NK buněčné rozpoznávání regulované glykosylací: strukturní biologie a nové metody analýzy glykopeptidů (2020 – 2023) - O. Vaněk
GA UK, 318122 Aktivační receptor NKp80 a jeho ligand AICL: struktura a vzájemná interakce v roztoku a na povrchu lidských NK buněk (2022 – 2024) - K. Pazderová / Z. Urbanová
GA UK, 358322 Interakce galektinu-3 s receptorem NKp30 a její role v protinádorové imunitní odpovědi (2022 – 2024) - M. Tulpa
GA UK, 285423 Nové rekombinantní imunocytokiny pro stimulaci protinádorové imunitní odpovědi (2023 – 2025) - N. Bragina
GA UK, 173923 Využití sortasy A pro přípravu polymerních imunoterapeutik a stanovení jejich protinádorové aktivity (2023 – 2025) - M. Hejl
GA ČR, 23-08490L Uspořádání komplexů NK buněčných receptorů s jejich ligandy na molekulární úrovni pohledem kvantitativní jednomolekulové mikroskopie (2023 – 2026) - O. Vaněk
GA ČR, 24-12553O Nový pohled: Inovativní zobrazovací přístupy ke zkoumání prostorového uspořádání imunitních receptorů a ligandů (2024 – 2027) - O. Skořepa
GA ČR, 25-18490S Strukturní imunologie NK buněčného rozpoznávání: od úniku nádoru k jeho zneškodnění (2025 – 2027) - O. Vaněk
MŠMT ČR, program INTER-ACTION, LUAUS25250 Využití molekulárních mechanismů NK buněčného rozpoznávání k protinádorové terapii (2025 – 2028) - O. Vaněk
Publikace
2024
Leonard E. K., Tomala J., Gould J. R., Leff M. I., Lin J. X., Li P., Porter M. J., Johansen E. R., Thompson L., Cao S. D., Hou S., Henclova T., Huliciak M., Sargunas P. R., Fabilane C. S., Vaněk O., Kovar M., Schneider B., Raimondi G., Leonard W. J., Spangler J. B. (2024): Engineered cytokine/antibody fusion proteins improve IL-2 delivery to pro-inflammatory cells and promote antitumor activity. JCI Insight 9, e173469. IF 6,3 DOI: 10.1172/jci.insight.173469
2023
Di Carluccio C., Milanesi F., Civera M., Abreu C., Sattin S., Francesconi O., Molinaro A., Vaněk O., Marchetti R., Silipo A. (2023): Tumor carbohydrate associated antigen analogs as potential binders for Siglec-7. Eur J Org Chem 26, e202300644. IF 3,261 DOI: 10.1002/ejoc.202300644
2022
Anderluh M., Berti F., Bzducha-Wróbel A., Chiodo F., Colombo C., Compostella F., Durlik K., Ferhati X., Holmdahl R., Jovanovic D., Kaca W., Lay L., Marinovic-Cincovic M., Marradi M., Ozil M., Polito L., Reina-Martin J. J., Reis C. A., Sackstein R., Silipo A., Švajger U., Vaněk O., Yamamoto F., Richichi B., van Vliet S. J. (2022): Recent advances on smart glycoconjugate vaccines in infections and cancer. FEBS J 289, 4251–4303. IF 5,622 DOI: 10.1111/febs.15909
Vaněk O., Kalousková B., Abreu C., Nejadebrahim S., Skořepa O. (2022): Natural killer cell-based strategies for immunotherapy of cancer. Adv Protein Chem Struct Biol 129, 91-133. IF 5,447 DOI: 10.1016/bs.apcsb.2022.02.001
Remans K., Lebendiker M., Abreu C., Maffei M., Sellathurai S., May M. M., Vaněk O., de Marco A. (2022): Protein purification strategies must consider downstream applications and individual biological characteristics. Microb Cell Fact 21, 52. IF 6,352 DOI: 10.1186/s12934-022-01778-5
Bláha J., Skálová T., Kalousková B., Skořepa O., Cmunt D., Grobárová V., Pazicky S., Poláchová E., Abreu C., Stránský J., Kovaľ T., Dušková J., Zhao Y., Harlos K., Hašek J., Dohnálek J., Vaněk O. (2022): Structure of the human NK cell NKR-P1:LLT1 receptor:ligand complex reveals clustering in the immune synapse. Nat Commun 13, 5022. IF 17,694 DOI: 10.1038/s41467-022-32577-6
2021
Stehlík Š., Henych J., Štenclová P., Král R., Zemenová P., Pangrác J., Vaněk O., Kromka A., Rezek B. (2021): Size and nitrogen inhomogeneity in detonation and laser synthesized primary nanodiamond particles revealed via salt-assisted deaggregation. Carbon 171, 230-239. IF 11,307 DOI: 10.1016/j.carbon.2020.09.026
Zouharová M., Vymětal J., Bednárová L., Vaněk O., Herman P., Vetýšková V., Poštulková K., Lingstaadas P. S., Vondrášek J., Boušová K. (2021): Intrinsically disordered protein domain of human ameloblastin in synthetic fusion with calmodulin increases calmodulin stability and modulates its function. Int J Biol Macromol 168, 1-12. IF 8,025 DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2020.11.216
Stehlík Š., Mermoux M., Schummer B., Vaněk O., Kolářová K., Štenclová P., Vlk A., Ledinský M., Pfeifer R., Romanyuk O., Gordeev I., Roussel-Dherbey F., Němečková Z., Henych J., Bezdička P., Kromka A., Rezek B. (2021): Size effects on surface chemistry and Raman spectra of sub-5 nm oxidized high-pressure high-temperature and detonation nanodiamonds. J Phys Chem C 125, 5647-5669. IF 4,177 DOI: 10.1021/acs.jpcc.0c09190
Anderluh M., Berti F., Bzducha-Wróbel A., Chiodo F., Colombo C., Compostella F., Durlik K., Ferhati X., Holmdahl R., Jovanovic D., Kaca W., Lay L., Marinovic-Cincovic M., Marradi M., Ozil M., Polito L., Reina-Martin J. J., Reis C. A., Sackstein R., Silipo A., Švajger U., Vaněk O., Yamamoto F., Richichi B., van Vliet S. J. (2021): Emerging glyco-based strategies to steer immune responses. FEBS J 288, 4746-4772. IF 5,622 DOI: 10.1111/febs.15830
Peleg Y., Vincentelli R., Collins B. M., Chen K., Livingstone E. K., Weeratunga S., Leneva N., Guo Q., Remans K., Perez K., Bjerga G. E. K., Larsen Ø., Vaněk O., Skořepa O., Jacquemin S., Poterszman A., Kjaer S., Christodoulou E., Albeck S., Dym O., Ainbinder E., Unger T., Schuetz A., Matthes S., Bader M., de Marco A., Storici P., Semrau M. S., Stolt-Bergner P., Aigner C., Suppmann S., Goldenzweig A., Fleishman S. J. (2021): Community-wide experimental evaluation of the PROSS stability-design method. J Mol Biol 433, 166964. IF 6,151 DOI: 10.1016/j.jmb.2021.166964
López-Méndez B., Baron B., Brautigam C. A., Jowitt T. A., Knauer S. H., Uebel S., Williams M. A., Sedivy A., Abian O., Abreu C., Adamczyk M., Bal W., Berger S., Buell A. K., Carolis C., Daviter T., Fish A., Garcia-Alai M., Guenther C., Hamacek J., Holková J., Houser J., Johnson C., Kelly S., Leech A., Mas C., Matulis D., McLaughlin S. H., Montserret R., Nasreddine R., Nehmé R., Nguyen Q., Ortega-Alarcón D., Perez K., Pirc K., Piszczek G., Podobnik M., Rodrigo N., Rokov-Plavec J., Schaefer S., Sharpe T., Southall J., Staunton D., Tavares P., Vaněk O., Weyand M., Wu D. (2021): Reproducibility and accuracy of microscale thermophoresis in the NanoTemper Monolith: a multi laboratory benchmark study. Eur Biophys J 50, 411-427. IF 2,095 DOI: 10.1016/10.1007/s00249-021-01532-6
Boušová K., Bednárová L., Zouharová M., Vetýšková V., Poštulková K., Hofbauerová K., Petrvalská O., Vaněk O., Tripsianes K., Vondrášek J. (2021): The order of PDZ3 and TrpCage in fusion chimeras determines their properties – a biophysical characterization. Protein Sci 30, 1653-1666. IF 6,993 DOI: 10.1002/pro.4107
Kalousková B., Skořepa O., Cmunt D., Abreu C., Krejčová K., Bláha J., Sieglová I., Král V., Fábry M., Pola R., Pechar M., Vaněk O. (2021): Tumor marker B7-H6 bound to the coiled coil peptide-polymer conjugate enables targeted therapy by activating human natural killer cells. Biomedicines 9, 1597. IF 4,757 DOI: 10.3390/biomedicines9111597
2020
Janisova L., Gruzinov A., Zaborova O. V., Velychkivska N., Vaněk O., Chytil P., Etrych T., Janoušková O., Zhang X., Blanchet C., Papadakis C. M., Svergun D. I., Filippov S. K. (2020): Molecular mechanisms of the interactions of N-(2-hydroxypropyl)methacrylamide copolymers designed for cancer therapy with the blood plasma proteins. Pharmaceutics 12, 106. IF 6,321 DOI: 10.3390/pharmaceutics12020106
Skořepa O., Pažický S., Kalousková B., Bláha J., Abreu C., Ječmen T., Rosůlek M., Fish A., Sedivy A., Harlos K., Dohnálek J., Skálová T., Vaněk O. (2020): Natural killer cell activation receptor NKp30 oligomerization depends on its N-glycosylation. Cancers 12, 1998. IF 6,639 DOI: 10.3390/cancers12071998
Sumová P., Polanská N., Leštinová T., Spitzová T., Kalousková B., Vaněk O., Volf P., Rohoušová I. (2020): Phlebotomus perniciosus recombinant salivary proteins polarize murine macrophages towards the anti-inflammatory phenotype. Front Cell Infect Microbiol 10, 427. IF 5,293 DOI: 10.3389/fcimb.2020.00427
Vetýšková V., Zouharová M., Bednárová L., Vaněk O., Sázelová P., Kašička V., Vymětal J., Srp J., Rumlová M., Charnavets T., Poštulková K., Reseland J. E., Boušová K., Vondrášek J. (2020): Characterization of AMBN I and II isoforms and study of their Ca2+-binding properties. Int J Mol Sci 21, 9293. IF 5,923 DOI: 10.3390/ijms21239293
Skálová T., Lengálová A., Dohnálek J., Harlos K., Mihalčin P., Kolenko P., Stráňava M., Bláha J., Shimizu T., Martínková M. (2020): Disruption of the dimerization interface of the sensing domain in the dimeric heme-based oxygen sensor AfGcHK abolishes bacterial signal transduction. J Biol Chem 295, 1587-1597. IF 5,157 DOI: 10.1074/jbc.RA119.011574
2019
Sumová P., Šíma M., Kalousková B., Polanská N., Vaněk O., Oliveira F., Valenzuela J. G., Volf P. (2019): Amine-binding properties of salivary yellow-related proteins in phlebotomine sand flies. Insect Biochem Mol Biol 115, 103245. IF 3,827 DOI: 10.1016/j.ibmb.2019.103245
Willen L., Leštinová T., Kalousková B., Sumová P., Spitzová T., Velez R., Domenech E., Vaněk O., Gállego M., Mertens P., Volf P. (2019): Field study of the improved rapid sand fly exposure test in areas endemic for canine leishmaniasis. PLoS Negl Trop Dis 13, e0007832. IF 3,885 DOI: 10.1371/journal.pntd.0007832
Vaněk O., Celadová P., Skořepa O., Bláha J., Kalousková B., Dvorská A., Poláchová E., Pucholtová H., Kavan D., Pompach P., Hofbauerová K., Kopecký V. Jr., Mesci A., Voigt S., Carlyle J. R. (2019): Production of recombinant soluble dimeric C-type lectin-like receptors of rat natural killer cells. Sci Rep 9, 17836. IF 3,998 DOI: 10.1038/s41598-019-52114-8
2018
Škerlová J., Bláha J., Pachl P., Hofbauerová K., Kukačka Z., Man P., Pompach P., Novák P., Otwinowski Z., Brynda J., Vaněk O., Řezáčová P. (2018): Crystal structure of native β-N-acetylhexosaminidase isolated from Aspergillus oryzae sheds light onto its substrate specificity, high stability, and regulation by propeptide. FEBS J 285, 580-598. IF 4,739 DOI: 10.1111/febs.14360
Malý M., Skálová T., Švecová L., Dohnálek J., Bláha J., Vaněk O., Harlos K., Kolenko P. (2018): Paired refinement: Impact of reintegration and rescaling. In: Dragounová K., ed. Sborník 8. Studentské vědecké konference fyziky pevných látek a materiálů FJFI ČVUT. Praha: České vysoké učení technické v Praze, s. 8-10. ISBN 978-80-01-06511-2
2017
Bláha J., Kalousková B., Skořepa O., Pažický S., Novák P., Vaněk O. (2017): High-level expression and purification of soluble form of human natural killer cell receptor NKR-P1 in HEK293S GnTI- cells. Protein Expr Purif 140, 36-43. IF 1,338 DOI: 10.1016/j.pep.2017.07.016
Stehlík Š., Varga M., Štenclová P., Ondič L., Ledinský M., Pangrác J., Vaněk O., Lipov J., Kromka A., Rezek B. (2017): Ultrathin Nanocrystalline Diamond Films with Silicon Vacancy Color Centers via Seeding by 2 nm Detonation Nanodiamonds. ACS Appl Mater Interfaces 9, 38842-38853. IF 8,097 DOI: 10.1021/acsami.7b14436
Stráňava M., Man P., Skálová T., Kolenko P., Bláha J., Fojtíková V., Martínek V., Dohnálek J., Lengálová A., Rosůlek M., Shimizu T., Martínková M. (2017): Coordination and redox state-dependent structural changes of the heme-based oxygen sensor AfGcHK associated with intraprotein signal transduction. J Biol Chem 292, 20921-20935. IF 4,011 DOI: 10.1074/jbc.M117.817023
2016
Doležal M., Zábranský A., Dostál J., Vaněk O., Brynda J., Lepšík M., Hadravová R., Pichová I. (2016): Myristoylation drives dimerization of matrix protein from mouse mammary tumor virus. Retrovirology 13, 2. IF 3,867 DOI: 10.1186/s12977-015-0235-8
Stráňava M., Martínek V., Man P., Fojtíková V., Kavan D., Vaněk O., Shimizu T., Martínková M. (2016): Structural Characterization of the Heme-based Oxygen Sensor, AfGcHK, its Interactions with the Cognate Response Regulator, and their Combined Mechanism of Action in a Bacterial Two-component Signaling System. Proteins 84, 1375-1389. IF 2,289 DOI: 10.1002/prot.25083
2015
Bláha J., Pachl P., Novák P., Vaněk O. (2015): Expression and purification of soluble and stable ectodomain of natural killer cell receptor LLT1 through high-density transfection of suspension adapted HEK293S GnTI- cells. Protein Expr Purif 109, 7-13. IF 1,407 DOI: 10.1016/j.pep.2015.01.006
Skálová T., Bláha J., Harlos K., Dušková J., Kovaľ T., Stránský J., Hašek J., Vaněk O., Dohnálek J. (2015): Four crystal structures of human LLT1, a ligand for human NKR-P1, in varied glycosylation and oligomerization states. Acta Crystallogr Sect D Biol Crystallogr 71, 578-591. IF 2,512 DOI: 10.1107/S1399004714027928
Machová I., Snášel J., Dostál J., Brynda J., Fanfrlík J., Singh M., Tarábek J., Vaněk O., Bednárová L., Pichová I. (2015): Structural and functional studies of phosphoenolpyruvate carboxykinase from Mycobacterium tuberculosis. PLoS ONE 10, e0120682. IF 3,057 DOI: 10.1371/journal.pone.0120682
Lynn G. M., Laga R., Darrah P. A., Ishizuka A. S., Balaci A. J., Dulcey A. E., Pechar M., Pola R., Gerner M. Y., Yamamoto A., Buechler C. R., Quinn K. M., Smelkinson M. G., Vaněk O., Cawood R., Hills T., Vasalatiy O., Kastenmüller K., Francica J. R., Stutts L., Tom J. K., Ryu K. A., Esser-Kahn A. P., Etrych T., Fisher K. D., Seymour L. W., Seder R. A. (2015): In vivo characterization of the physicochemical properties of polymer-linked TLR agonists that enhance vaccine immunogenicity. Nat Biotechnol 33, 1201-1210. IF 43,113 DOI: 10.1038/nbt.3371
Spolupráce
Akademická pracoviště
Dr. Mario Brameshuber, Technická Univerzita Vídeň, Rakousko
prof. Ario de Marco, Univerzita Nova Gorica, Slovinsko
prof. James R. Carlyle, Univerzita Toronto, Kanada (in memoriam)
Dr. Jakub Tomala, prof. Jamie Spangler, Univerzita Johna Hopkinse, USA
Dr. Jan Dohnálek, BTÚ AV ČR, BIOCEV
Dr. Michal Pechar, ÚMCH AV ČR
Průmysl a komerční sféra
Merck s.r.o. (2010-2018)
IOCB TECH s.r.o. (2017–2018)
PROGEN Biotechnik GmbH (2021)
Výuka
Pokročilé praktikum z biochemie (ZS 0/4 Z) - MC250C17A
Pokročilé praktikum z biochemie pro KATA (LS 0/3 Z) - MC250C03
Pokročilé praktikum II (LS 0/2 Z) - MC250C08
Biologie pro biochemiky (ZS 2/0 Zk) - MC250P49
Therapeutic proteins (LS 2/0 Zk) - MC250P67
Úvod do přenosu znalostí a technologií (ZS 2/0 Zk) - MS750P02
Management biochemie (LS 2/0 Zk) - MC250P50
Obhájených bakalářských prací: 41
Obhájených magisterských prací: 27
Obhájené disertační práce: 3
Alumni
Vedení bakalářských prací
Hájková Alena (2007): Příprava vektoru pro rekombinantní expresi lidského proteinu NKR-P1, receptoru NK buněk
Němcová Petra (2007): Příprava vektoru pro rekombinantní expresi proteinu NKR-P1A, receptoru potkaních NK buněk
Novotná Lenka (2008): Příprava vektoru pro rekombinantní expresi proteinu NKR-P1B, receptoru potkaních NK buněk
Celadová Petra (2008): Klonování a amplifikace isoforem b a g genu Clr, ligandu pro receptory Nkrp1 myších NK buněk
Holubová Martina (2008): Klonování a amplifikace isoforem B, D a F proteinu NKR-P1, receptoru myších NK buněk
Bláha Jan (2010): Optimalizace rekombinantní exprese proteinů v HEK293 buněčné linii
Čuperková Romana (2012): Optimalizace kultivačního média HEK293 buněčné linie
Dvorská Anna (2012): Příprava a studium komplexu potkaních NK buněčných receptorů NKR-P1B A Clrb
Leontovyč Adrian (2012): Příprava expresního vektoru pro produkci receptorů CD69 a S1P1
Poláchová Edita (2012): Příprava expresních vektorů regulujících buněčný cyklus a apoptózu pro optimalizaci expresního systému HEK293 buněčné linie
Pucholtová Helena (2012): Příprava dimerní formy myšího NK buněčného receptoru NKR-P1C
Illéš David (2013): Optimalizace purifikace rekombinantní nitrilasy z Arthroderma benhamiae
Mikulová Barbora (2013): Příprava expresních vektorů pro NKp65 a KACL, nové zástupce rodiny lidských NK buněčných receptorů
Nový Jiří (2013): Příprava lidského NK buněčného receptoru KACL
Petermannová Romana (2013): Produkce auxinového transportéru PIN1 v HEK293 buněčné linii
Slavata Lukáš (2013): Příprava plazmidů pro expresi interleukin 2-fúzní monoklonální protilátky
Kalousková Barbora (2014): Příprava glykosylované formy lidského imunoreceptoru NKp30
Pažický Samuel (2014): Příprava expresních vektorů pro receptor NKp30 a jeho ligandy B7-H6 a BAG-6
Skořepa Ondřej (2014): Příprava lentivirového expresního vektoru s reportérovým genem
Gáthy Lajos (2015): Rekombinantní exprese a purifikace C324S modifikované nitrilasy z Arthroderma benhamiae
Prokopová Tereza (2015): Produkce a purifikace rekombinantního receptoru Clrb
Herynek Štěpán (2017): Rekombinantní příprava jaderného antigenu proliferujících buněk (PCNA)
Krejčová Kateřina (2017): Příprava nádorového ligandu B7-H6 s coiled-coil kotvou a ověření jeho vazby na receptor NKp30
Hausleitner Filip (2018): Vliv mutace S159A na oligomerní stav NKR-P1A receptoru lidských NK buněk
Houserová Jana (2018): Rekombinantní exprese proteinu NKp46 a jeho ligandu Epa1
Nepokojová Tereza (2018): Příprava fúzních ligandů a ověření jejich vazby na NK buněčné receptory
Runová Alžběta (2018): Příprava receptoru AICL ve fúzi s Fc fragmentem lidského IgG
Rožová Dominika (2020): Příprava myšího interleukinu 2 spojeného s monoklonální protilátkou S4B6
Gabriela Chytrá (2021): Studium vlivu N-vázané glykosylace na funkci nanoprotilátky cílící receptor HER2
Hejl Maxmilián (2021): Optimalizace in vitro testů zaměřených na aktivaci NK buněk
Kozojedová Petra (2021): Příprava reportérové buněčné linie pro ověření biologické aktivity rekombinantních proteinů
Pazderová Kristýna (2021): Mutageneze a exprese proteinu NKp80, aktivačního receptoru lidských lymfocytů
Tulpa Matouš (2021): Galektin-3 a jeho interakce s receptorem přirozené cytotoxicity NKp30
Bragina Nadezda (2022): Příprava rekombinantních substrátů pro transpeptidasovou reakci
Dubanych Yurii (2022): Produkce a charakterizace mutované formy galektinu-3
Rudenko Anastassiya (2022): Rekombinantní exprese receptoru myších NK buněk NKR-P1C
Urbanová Zuzana (2022): Rekombinantní exprese potkaního NK buněčného receptoru Clr-b v přítomnosti fluorovaných analogů monosacharidů
Jeníček Jakub (2023): Příprava vazebné domény proteinu B7-H6 s vysokou afinitou
Cibiková Tereza (2024): Příprava anti-CD20 vazebné domény a její konjugace na polymerní nosič
Maksimova Anna Dmitryvna (2024): Produkce rozpustné formy lidského NK buněčného receptoru NKR-P1 a jeho ligandu LLT1
Murajdová Viktória (2024): Optimalizace rekombinantní exprese proteinů v lidské buněčné linii HEK293
Vedení diplomových prací
Hájková Alena (2009): Rekombinantní exprese a studium receptoru hNKR-P1
Němcová Petra (2009): Rekombinantní exprese a studium receptoru rNKR-P1A
Celadová Petra (2010): Rekombinantní příprava receptorů potkaních NK buněk v expresním systému HEK293T
Bláha Jan (2012): Příprava a studium lidského lymfocytárního receptoru LLT1
Dvorská Anna (2014): Strukturní biologie komplexu potkaních NK buněčných receptorů NKR-P1B a Clrb
Hradilová Iveta (2014): Příprava a studium vlastností kyanidhydratasy z Aspergillus niger a nitrilasy z Arthroderma benhamiae
Poláchová Edita (2014): Optimalizace expresního systému HEK293 buněčné linie pomocí regulace buněčného cyklu a apoptózy
Pucholtová Helena (2014): Produkce myšího NK buněčného receptoru NKR-P1C a hledání jeho ligandu
Zawadová Dorota (2014): Rekombinantní exprese a purifikace nitrilasy z Neurospora crassa
Nový Jiří (2015): Příprava a studium lidského NK buněčného receptoru AICL
Petermannová Romana (2015): Příprava HEK293 buněčné linie exprimující transportér auxinu PIN7 a testování inhibitorů přenosu auxinu
Kalousková Barbora (2016): Příprava lidského NK buněčného aktivačního receptoru NKp80 a jeho ligandu AICL
Pažický Samuel (2016): Study of NKp30 oligomerization and its interaction with B7-H6
Skořepa Ondřej (2016): Strukturní studium potkaního NK buněčného receptoru NKR-P1B a jeho ligandu Clrb
Abreu de Sousa Santos Celeste (2019): Interaction of Galectin-1 with human NK cell receptors
Cmunt Denis (2019): Příprava fúzních domén lidských imunoreceptorů pro jejich využití v imunoterapii
Herynek Štěpán (2019): Strukturní biologie receptoru NKp44 a jeho ligandu PCNA
Houserová Jana (2020): Studium interakce receptoru NKp46 s adhesinem Epa1
Frantová Eliška (2022): Produkce IL2-fúzních protilátek a stanovení jejich biologické aktivity
Malá Viktorie (2022): Příprava mutovaných forem proteinu B7-H6
Bednaříková Kristýna (2023): Produkce rekombinantního IL-2 imunocytokinu nového typu
Hejl Maxmilián (2033): Příprava polymerního terapeutika cílícího na CD20 pozitivní B lymfomy a NK buňky
Tulpa Matouš (2023): Role N-glykosylace v homooligomerizaci receptoru přirozené cytotoxicity NKp30
Chytrá Gabriela (2024): Aktivace protinádorové imunitní odpovědi s pomocí bispecifických fúzních proteinů
Otépka Tomáš (2024): Příprava růstového faktoru TGF-β3 s coiled-coil kotvou
Dubanych Yurii (2024): Characterization of the interaction of galectin-3 with the natural cytotoxicity receptor NKp30
Pazderová Kristýna (2024): Structural biochemistry of protein NKp80, an activation receptor of human lymphocytes
Vedení disertačních prací
Bláha Jan (2017): Study of structure and interaction of human lymphocyte receptors
Skořepa Ondřej (2021): Structural biochemistry of human NK cell receptor complex NKp30 and B7-H6
Kalousková Barbora (2022): Harnessing soluble forms of NK cell receptors and their ligands for cancer immunotherapy