Nabídka části témat bakalářských a diplomových pro akademický rok 2024/25

Katedra biochemie nabízí studentům níže uvedená témata bakalářských (pdf ke stažení) a diplomových (pdf ke stažení) projektů. Je zvykem, že studenti nejprve kontaktují vedoucího práce, které je nejvíce oslovuje, a domluví se s ním na spolupráci (e-mailový kontakt je uveden v SIS). Je potřeba počítat s tím, že vedoucí prací se již mohli domluvit s jinými studenty, kteří byli v jednání rychlejší nebo pokračují ve své práci z bakalářského studia. Nabízených témat je nicméně výrazně více, než studentů zapsaných v prvním ročníku navazujícího magisterského studia (v případě diplomové práce) nebo ve třetím ročníku bakalářského studia (v případě bakalářské práce), není proto třeba se obávat, že na někoho žádné téma nezůstane. Nenechejte však výběr Vaší práce na poslední chvíli!

Dle harmonogramu jsou témata již v SIS a studenti se na ně po dohodě s vedoucím dané práce nejpozději do 14. 1. 2025 přihlásí. Poté školitelé potvrdí, že budou přihlášené studenty školit, a pak již nic nebrání tomu, aby studenti na daném projektu začali pracovat.

 

 

Seznam bakalářských prací

Baluchová Simona (PřF UK, simona.baluchova@natur.cuni.cz)

BP1: Vývoj nových elektrochemických metod pro stanovení hormonů štítné žlázy (konzultant: Dr. H. Dračínská)

 

Bojarová Pavla (MBÚ AV ČR, v.v.i.; bojarova@biomed.cas.cz)

BP1: Sekvenční syntéza cukerných nukleotidů

BP2: Značené konstrukty galektinů pro biomedicínské aplikace

 

Bouřa Evžen (ÚOCHB AV ČR v.v.i.; evzen.boura@uochb.cas.cz)

DP1: Charakterizace vybraných methyltransferáz z patogenních bakterií (až pro dva studenty)

 

Burská Daniela (1. LF UK, daniela.burska@lf1.cuni.cz)

BP1: Studium organizace mitochondriálních superkomplexů a patomechanismů deficience komplexu III dýchacího řetězce (konzultant: Dr. H. Hansíková)

 

Dohnálek Jan (BIOCEV AV ČR v.v.i., Jan.Dohnalek@ibt.cas.cz)

BP1: Enzymová kinetika proteinu HelD (konzultant: Dr. P. Man)

 

Dračínská Helena (PřF UK, helena.dracinska@natur.cuni.cz)

BP1: Vliv směsí doplňků stravy s kurkuminem na aktivitu cytochromu P450 2C9

 

Etrych Tomáš (AV ČR, v.v.i.; etrych@imc.cas.cz)

BP1: Dopravní systémy léčiv s gradientovou strukturoupolymer (konzultant: Dr. P. Chytil)

BP2: Cílená léčiva na bázi hybridních systémů protilátka-syntetický polymer

BP3: Nanoléčiva pro léčbu nádorů slinivky břišní (konzultant: Dr. R Pola)

 

Hansíková Hana (1. LF UK, Hana.Hansikova@vfn.cz)

BP1: Dopad mírné a těžké hypoxie na mitochondriální metabolismus (konzultant: Mgr. J. Křížová)

 

Heidingsfeld Olga (PřF UK/ÚOCHB AV ČR v.v.i., olga.heidingsfeld@natur.cuni.cz)

BP1: Substrátová specifita mikrobiálních fosfatas podílejících se na opravách chybných metabolitů

BP2: Strukturní analýza a inhibice karbonických anhydras patogenních kvasinek rodu Candida

BP3: Jaká je funkce proteinu Het1p patogenní kvasinky Candida albicans?

 

Hodek Petr (PřF UK; petr.hodek@natur.cuni.cz)

BP1: Studium profylaktického účinku slepičích protilátek na kvasinková onemocnění

BP2: Studium interakce placentární aromatasy s parfémy

BP3: Studium vlivu směsi potravních doplňků na trávicí enzymy (konzultant: Dr. K. Bělonožníková)

 

Hýsková Veronika (PřF UK, veronika.hyskova@natur.cuni.cz)

BP1: Biochemická charakterizace rostlin kopřiv

 

Indra Radek (PřF UK, radek.indra@natur.cuni.cz)

BP1: Optimalizace přípravy rekombinantního CYP3A4

BP2: Vzájemný vliv mikrobiomu a tyrosinkinasových inhibitorů

 

Ječmen Tomáš (PřF UK, tomas.jecmen@natur.cuni.cz)

BP1: Vliv složení detritu na růst a vývoj kriticky ohrožené perlorodky říční (konzultant: Dr. K. Bělonožníková)

BP2: Exprese a purifikace mutantů cytochromu b5 s nepřirozenými aminokyselinami

 


Koblas Tomáš
(IKEM; tokb@medicon.cz)              

BP1: In vitro příprava a charakterizace imunogenních vlastností modifikovaných mediátorových RNA

 

Kubíčková Božena (PřF UK, bozena.kubickova@natur.cuni.cz)

BP1: Příprava slepičích žloutkových protilátek proti flagellárnímu virulenčnímu faktoru Pseudomonas aeruginosa

 

Man Petr (AV ČR, v.v.i.; pman@biomed.cas.cz)

BP1: Hmotnostní spektrometrie membránových proteinů.

 

Martínková Markéta (PřF UK, marketa.martinkova@natur.cuni.cz)

BP1: Identifikace nových zástupců hemových senzorových protein a jejich biochemická charakterizace

 

Novák Petr (PřF UK, petr.novak@natur.cuni.cz)

BP1: Vývoj metod pro kvantifikaci biologických terapeutik v pacientských vzorcích

 

Osičková Adriana (PřF UK/AV ČR v.v.i.; osickova@biomed.cas.cz)

BP1 Studium proteinových interakcí podílejících se na acylaci α-hemolyzinu bakterie Escherichia coli

 

Pačesová Andrea (ÚOCHB AV ČR v.v.i., andrea.pacesova@uochb.cas.cz)

BP1: Interakce lipidizovaných analogů peptidu CART (cocaine- and amphetamine-regulated transcript)  s primárními kulturami tanycytů (konzultant: Dr. Maletínská)

 

Pompach Petr (Biocev AV ČR v.v.i.; petrpompach@gmail.com)

BP1: Optimalizace využití imunoafinitních čipů ve spojení s hmotnostně spektrometrickou detekcí

 

Smith Joshua (OÚCHB AV ČR v.v.i., joshua.smith@uochb.cas.cz)

BP1: The development of a microfractionation method for plant extracts and subsequent antimicrobial screening

 

Srp Jaroslav (OÚCHB AV ČR v.v.i., jaroslav.srp@uochb.cas.cz)

BP1: Příprava modelové aspartátové proteasy a vysokokapacitního systému pro testování jejich inhibitorů (konzultant: Doc. O. Heidingsfeld)

 

Strnadová Veronika (ÚOCHB AV ČR v.v.i., veronika.strnadova@uochb.cas.cz)

BP1: Studium vztahu struktury a aktivity peptidu uvolňujícího prolaktin (PrRP) a neuropeptidu FF (NPFF) a jejich signalizačních drah (konzultant: Dr. Maletínská)

 

Šulc Miroslav (PřF UK; miroslav.sulc@natur.cuni.cz)

BP1: Využití nekanonických aminokyselin pro studium proteinové struktury a interakcí/koordinace kovu a přenosu elektronů v modelovém metaloproteinu (azurin z organismu P. aeruginosa)

 

Tachézy Ruth (Biocev AV ČR v.v.i.; ruth.tachezy@natur.cuni.cz)

BP1: Nepřímé metody detekce HPV-specifických protilátek

 

Vaněk Ondřej (PřF UK, ondrej.vanek@natur.cuni.cz)

BP1: Produkce rozpustné formy proteinu RCTL potkaního cytomegaloviru

BP2: Příprava mutovaného proteinu CD69, receptoru lidských lymfocytů

 

Seznam diplomových prací

Bělonožníková Kateřina (PřF UK; katerina.belonoznikova@natur.cuni.cz)

DP1: Analýza přírodních fermentovaných produktů jako biostimulantů obranyschopnosti rostlin (konzultant: prof. H. Ryšlavá)

DP2: Účinky biostimulantů na biotransformační systém rostlin a efektivitu fytoremediace (konzultant: Doc. S. Smrček)

 

Bojarová Pavla (MBÚ AV ČR, v.v.i.; bojarova@biomed.cas.cz)

DP1: Cílená mutageneze glykosidas a analýza jejich substrátové specifity

 

Bouřa Evžen (ÚOCHB AV ČR v.v.i.; evzen.boura@uochb.cas.cz)

DP1: Charakterizace vybraných methyltransferáz z patogenních bakterií (až pro dva studenty)

 

Dračínská Helena (PřF UK, helena.dracinska@natur.cuni.cz)

DP1: Vliv směsí potravinových doplňků na cytochromy P450 (konzultant: prof. H. Ryšlavá)

 

Eckschlager Tomáš (1.LF UK, tomas.eckschlager@lfmotol.cuni.cz)

DP1: Lokální léčba mozkových nádorů pomocí cytostatik vázaných na vlákna kyseliny hyaluronové- studie in vitro

DP2: Expresní profil lysin demethylázy u dětských nádorů

 

Etrych Tomáš (AV ČR, v.v.i.; etrych@imc.cas.cz)

DP1: Dopravní systémy léčiv s gradientovou strukturou (konzultant: Dr. P. Chytil)

DP2: Hybridní systémy protilátka-syntetický polymer jako cílená protinádorová léčiva

DP3: Biokompatibilní polymerní systémy pro medicinální použití (konzultant: Dr. L. Kotrchová)

 

Hansíková Hana (1. LF UK, Hana.Hansikova@vfn.cz)

DP1: Mitochondriální biomarkery u Friedreichovy ataxie (konzultant: Mgr. M. Vanišová)

DP2: Dopad mírné a těžké hypoxie na mitochondriální metabolismus (konzultant: Mgr. J. Křížová)

 

Hodek Petr (PřF UK; petr.hodek@natur.cuni.cz)

DP1: Vývoj antibakteriálních protilátek pro pacienty s cystickou fibrosou

 

Hýsková Veronika (PřF UK, veronika.hyskova@natur.cuni.cz)

DP1: Zmírnění stresu suchem u rostlin prostřednictvím biostimulantu

 

Indra Radek (PřF UK, radek.indra@natur.cuni.cz)

DP1: Vliv přírodních látek na mikrobiom

 

Ječmen Tomáš (PřF UK, tomas.jecmen@natur.cuni.cz)

DP1: Chemická modifikace glykopeptidů a predikce jejich retenčního chování při hydrofilní kapalinové chromatografii (Konzultant: doc. P. Kozlík)

DP2: Exprese a purifikace mutantů cytochromu b5 s nepřirozenými aminokyselinami

 

Koblas Tomáš (IKEM; tokb@medicon.cz)

DP1: In vitro připrava modifikovaných mediátorových RNA kódujících regulátory buněčného cyklu pro účely stimulace proliferace pankreatických beta buněk

 

Kukačka Zdeněk (Biocev AV ČR v.v.i., zdenek.kukacka@biomed.cas.cz)

DP1: Vývoj kovalentního značení proteinů pomocí nové generace Togniho činidel

 

Man Petr (AV ČR, v.v.i.; pman@biomed.cas.cz)

DP1: Strukturní proteomika sérových proteinů

DP2: Strukturní dynamika membránových proteinů.

 

Martínková Markéta (PřF UK, marketa.martinkova@natur.cuni.cz)

DP1: Strukturně-funkční mechanismy modelových zástupců hemových senzorových proteinů

 

Obšil Tomáš (PřF UK/FgÚ BIOCEV AV ČR v.v.i., tomas.obsil@natur.cuni.cz)

DP1: Molekulární mechanismus aktivace lidské proteinkinasy ASK1 (Apoptosis signal-regulating kinase 1)

 

Obšilová Veronika (FgÚ BIOCEV AV ČR v.v.i., veronika.obsilova@fgu.cas.cz)

DP1: Studium molekulárního mechanismu regulace E3 ubikvitinligas z Nedd4 rodiny pomocí proteinu Ndfip2

 

Novák Petr (PřF UK, petr.novak@natur.cuni.cz)

DP1: Non-canonical interacting partners of glycogen synthase kinase 3b

DP2: Vývoj metod pro kvantifikaci biologických terapeutik v pacientských vzorcích

 

Petrášek Jan (ÚEB UK, jan.petrasek@natur.cuni.cz)

DP1: Příprava nových reportérů auxinové signální dráhy a jejich testování.

 

Pompach Petr (Biocev AV ČR v.v.i.; petrpompach@gmail.com)

DP1: Příprava imunoafinitních čipů pro klinickou diagnostiku

 

Šulc Miroslav (PřF UK; miroslav.sulc@natur.cuni.cz)

DP1: Studium proteinové struktury a interakcí s využitím nekanonických aminokyselin a strukturně-funkční proteomiky (model: lidský kalmodulin nebo metaloprotein azurin P. aeruginosa)

 

Vaněk Ondřej (PřF UK, ondrej.vanek@natur.cuni.cz)

DP1: Studium struktury a interakce lidského NK buněčného aktivačního receptoru NKp80 a jeho ligandu AICL

DP2: Terapeutické využití vazebných domén a ligandů NK buněčných receptorů