2023

Publikace členů a studentů katedry v r. 2023

Původní a přehledové články v časopisech s IF

* Beňová A., Ferenčáková M., Bardová K., Funda J., Procházka J., Spoutil F., Čajka T., Džubanová M., Balcaen T., Kerckhofs G., Willekens W., van Lenthe G.H., Charyyeva A., Alquicer G., Pecinová A., Mráček T., Horáková O., Coupeau R., Hansen M.S., Rossmeisl M., Kopecký J., Tencerová M. (2023): Omega-3 PUFAs prevent bone impairment and bone marrow adiposity in mouse model of obesity. Commun. Biol. 6 (1): 1043. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,2 (WoS Q1)

Budil J., Štenclová P., Kromka A., Lišková P. (2023): Development of the Pseudomonas syringae pv. morsprunorum biofilm monitored in real time using attenuated total reflection Fourier transform infrared measurements in a flow cell chamber. Appl. Spectrosc. 77 (5): 500-512.  [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,2 (WoS Q1/Q2)

Dejmek M., Brázdová A., Otava T., Pimková Polidarová M., Klíma M., Smola M., Vavřina Z., Buděšínský M., Dračínský M., Liboska R., Bouřa E., Birkuš G., Nencka R. (2023): Vinylphosphonate-based cyclic dinucleotides enhance STING-mediated cancer immunotherapy. Eur. J. Med. Chem. 259: 115685. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  6,0 (WoS Q1)

* Dong L.F., Rohlena J., Zobalová R., Nahácka Z., Rodriguez A.M., Berridge M.V., Neužil J. (2023): Mitochondria on the move: Horizontal mitochondrial transfer in disease and health. J. Cell Biol. 222 (3): e202211044. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  7,4 (WoS Q1)

* Ferenčáková M., Beňová A., Raška I. Jr., Abaffy P., Šindelka R., Džubanová M., Pospíšilová E., Kološtová K., Čajka T., Paclík A., Zikán V., Tencerová M. (2023): Human bone marrow stromal cells: the impact of anticoagulants on stem cell properties. Front. Cell Dev. Biol. 11: 1255823. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,6 (WoS Q1/Q2)

Filipi T., Matúšová Z., Abaffy P., Vaňátko O., Turečková J., Benešová S., Kubisková M., Kirdajová D., Záhumenský J., Valihrach L., Anděrová M. (2023): Cortical glia in SOD1(G93A) mice are subtly affected by ALS-like pathology. Sci. Rep.  13 (1): 6538. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,8 (WoS Q2)

* Gregório C., Thakur S., Camara Rivero R., Márcia Dos Santos Machado S., Cuenin C., Carreira C., White V., Cree I.A., Vukojevic K., Glavina Durdov M., Bersch Osvaldt A., Ashton-Prolla P., Herceg Z., Talukdar F.R. (2023): Telomere length assessment and molecular characterization of TERT gene promoter in periampullary carcinomas. Gene 873: 147460. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,6 (WoS Q2)

Haas M., Fürhacker P., Hodek J., Stangl P., Alon I., Kainz K., Fajgelj V., Mädel C., Dotzler S., Götzinger F., Ulrychová L., Preuner S., Fortschegger M., Schinnerl D., Walter C., Obrova K., Weber J., Zacharasiewicz A., Lion T. (2023): Detection of viable SARS-CoV-2 on the hands of hospitalized children with COVID-19. Clin. Microbiol. Infect. 29 (9): 1211-1213. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  10,9 (WoS Q1)

Hejtmánková A., Caisová H., Tomanová T., Španielová H. (2023): The role of the DE and EF loop of BKPyV VP1 in the serological cross-reactivity between subtypes. Virus Res. 324: 199031. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,5 (WoS Q3)

Hovorková M., Červený J., Bumba L., Pelantová H., Cvačka J., Křen V., Renaudet O., Goyard D., Bojarová P. (2023): Advanced high-affinity glycoconjugate ligands of galectins. Bioorg. Chem. 131: 106279. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,5 (WoS Q1)

* Hrabalová P., Bohuslavová R., Matějková K., Papoušek F., Sedmera D., Abaffy P., Kolář F., Pavlínková G. (2023): Dysregulation of hypoxia-inducible factor 1α in the sympathetic nervous system accelerates diabetic cardiomyopathy. Cardiovasc. Diabetol.  22 (1): 88. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  8,5 (WoS Q1)

Hrbáček J., Hanáček V., Kadlečková D., Cirbusová A., Čermák P., Tachezy R., Zachoval R., Saláková M. (2023): Urinary shedding of common DNA viruses and their possible association with bladder cancer: a qPCR-based study. Neoplasma 70 (2): 311-318. [PubMed] IF₂₀₂₂ =  2,0 (WoS Q3)

Huber B.A., Meng G., Král J., Ávila Herrera I.M., Izquierdo M.A. (2023): Revision of the South American Ninetinae genus Guaranita (Araneae, Pholcidae). Eur. J. Taxon. 900: 32-80. [Eur. J. Taxon.] IF₂₀₂₃ =  1,1 (WoS Q3)

Huber B.A., Meng G., Král J., Ávila Herrera I.M., Izquierdo M.A., Carvalho L S. (2023): High and dry: integrative taxonomy of the Andean spider genus Nerudia (Araneae: Pholcidae). Zool. J. Linn. Soc. 198 (2): 534-591.  [OUP] IF₂₀₂₃ =  3,0 (WoS Q1)

Huber B.A., Meng G., Valdez-Mondragón A., Král J., Ávila Herrera I.M., Carvalho L.S. (2023). Short-legged daddy-long-leg spiders in North America: the genera Pholcophora and Tolteca (Araneae, Pholcidae). Eur. J. Taxon.  880 (1): 1-89. [Eur J Taxon] IF₂₀₂₃ =  1,1 (WoS Q3)

* Chaudhari A.S., Chatterjee A., Domingos C.A.O., Andrikopoulos P.C., Liu Y., Andersson I., Schneider B., Lórenz-Fonfría V.A., Fuertes G. (2023): Genetically encoded non-canonical amino acids reveal asynchronous dark reversion of chromophore, backbone, and side-chains in EL222. Protein Sci. 32 (4): e4590. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,5 (WoS Q1)

Iyyappan R., Aleshkina D., Ming H., Dvořan M., Kakavand K., Jansová D., Del Llano E., Gahurova L., Bruce A.W., Mašek T., Pospíšek M., Horvát F., Kubelka M., Jiang Z., Susor A. (2023): The translational oscillation in oocyte and early embryo development. Nucleic Acids Res. 51 (22): 12076-12091. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  16,6 (WoS Q1)

Kadlečková D., Vinkler M., Tachezy R., Saláková M. (2023): Genome sequence of parvovirus from budgerigar (Melopsittacus undulatus). Microbiol. Resour. Announc. 12 (11): e0045323. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  0,7 (WoS Q4)

Kertisová A., Žáková L., Macháčková K., Marek A., Šácha P., Pompach P., Jiráček J., Selicharová I. (2023): Insulin receptor Arg717 and IGF-1 receptor Arg704 play a key role in ligand binding and in receptor activation. Open Biol. 13 (11): 230142. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,5 (WoS Q1)

Kliegr T., Jarkovský J., Jiřincová H., Kuchař J., Karel T., Chudán D., Vojíř S., Zavřel M., Šanca O., Tachezy R. (2023): Can variants, reinfection, symptoms and test types affect COVID-19 diagnostic performance? A large-scale retrospective study of AG-RDTs during circulation of Delta and Omicron variants, Czechia, December 2021 to February 2022. Eurosurveillance 28 (38): 2200938. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  9,9 (WoS Q1)

Konvalinková D., Dolníček F., Hovorková M., Červený J., Kundrát O., Pelantová H., Petrásková L., Cvačka J., Faizulina M., Varghese B., Kovaříček P., Křen V., Lhoták P., Bojarová P. (2023): Glycocalix[4]arenes and their affinity to a library of galectins: the linker matters. Org. Biomol. Chem. 21 (6): 1294-1302. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,9 (WoS Q1)

Křístková B., Rädisch R., Kulik N., Horvat M., Rucká L., Grulich M., Rudroff F., Kádek A., Pátek M., Winkler M., Martínková L. (2023): Scanning aldoxime dehydratase sequence space and characterization of a new aldoxime dehydratase from Fusarium vanettenii. Enzyme Microb. Technol. 164: 110187. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,4 (WoS Q2)

* Kuzma J., Zavala-Meneses S.G., Skultéty L., Chmelař D., Fičík J., Palcová L. (2023): Antibiotic resistance and biofilm-forming ability of α-toxin-positive Clostridium septicum isolates worsen patient prognosis. APMIS 131 (8): 434-441. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,2 (WoS Q3/Q4)

Látrová K., Dolejšová T., Motlová L., Mikušová G., Bosák J., Snopková K., Šmajs D., Konopásek I., Fišer R. (2023) R-type fonticins produced by Pragia fontium form large pores with high conductance. J. Bacteriol. 205 (1): e0031522. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,7 (WoS Q3)

Le A.V., Větrovský T., Barucic D., Saraiva J.P., Dobbler P.T., Kohout P., Pospíšek M., da Rocha U.N., Kléma J., Baldrian P. (2023): Improved recovery and annotation of genes in metagenomes through the prediction of fungal introns. Mol. Ecol. Resour. 23 (8): 1800-1811. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,5 (WoS Q1)

* Liu Y., Chaudhari A.S., Chatterjee A, Andrikopoulos P.C., Picchiotti A., Rebarz M., Kloz M., Lorenz-Fonfria V.A., Schneider B., Fuertes G. (2023): Sub-millisecond photoinduced dynamics of free and EL222-bound FMN by stimulated Raman and visible absorption spectroscopies. Biomolecules 13 (1): 161. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,8 (WoS Q1)

Lobaz V., Liščáková V., Sedlák F., Musil D., Petrova S.L., Šeděnková I., Pánek J., Kučka J., Konefał R., Tihlaříková E., Neděla V., Pankrác J., Šefc L., Hrubý M., Šácha P., Štěpánek P. (2023): Tuning polymer-blood and polymer-cytoplasm membrane interactions by manipulating the architecture of poly(2-oxazoline) triblock copolymers. Colloids Surf. B Biointerfaces 231: 113564. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,4 (WoS Q2/Q1)

Lukšíková K., Pavlica T., Altmanová M., Štundlová J., Pelikánová Š, Simanovsky S.A., Krysanov E.Y., Jankásek M., Hiřman M., Reichard M., Ráb P., Sember A. (2023): Conserved satellite DNA motif and lack of interstitial telomeric sites in highly rearranged African Nothobranchius killifish karyotypes.  J. Fish Biol. 103 (6): 1501-1514.  [PubMed] IF₂₀₂₃ =  1,7 (WoS Q2)

Marková H., Tarkowská D., Čečetka P., Kočová M., Rothová O., Holá D. (2023): Contents of endogenous brassinosteroids and the response to drought and/or exogenously applied 24-epibrassinolide in two different maize leaves. Front. Plant Sci. 14: 1139162 [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,1 (WoS Q1)

* Matúšová Z., Hol E.M., Pěkný M., Kubista M., Valihrach L. (2023): Reactive astrogliosis in the era of single-cell transcriptomics. Front. Cell. Neurosci. 17: 1173200. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,2 (WoS Q2)

Müllerová M., Hovorková M., Závodná T., Červenková Štastná L., Krupková A., Hamala V., Nováková K., Topinka J., Bojarová P., Strašák T. (2023): Lactose-functionalized carbosilane glycodendrimers are highly potent multivalent ligands for galectin-9 binding: increased glycan affinity to galectins correlates with aggregation behavior. Biomacromolecules 24 (11): 4705-4717. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,5 (WoS Q1)

Novák K., Valčíková T., Samaké K., Bjelka M. (2023): Association of variants in innate immune genes TLR4 and TLR5 with reproductive and milk production traits in Czech Simmental cattle. Genes 15 (1): 24. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,8 (WoS Q2)

* Osičková A., Knoblochová Š., Bumba L., Man P., Kalaninová Z., Lepesheva A., Jurnečka D., Čížková M., Biedermannová L., Goldsmith J.A., Maynard J.A., McLellan J.S., Osička R., Šebo P., Mašín J. (2023): A conserved tryptophan in the acylated segment of RTX toxins controls their β₂ integrin-independent cell penetration. J. Biol. Chem. 299 (8): 104978. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,0 (WoS Q2)

Plecitá-Hlavatá L., Brázdová A., Křivonosková M., Hu C.J., Phang T., Tauber J., Li M., Zhang H., Hoetzenecker K., Crnkovic S., Kwapiszewska G., Stenmark K.R. (2023): Microenvironmental regulation of T-cells in pulmonary hypertension. Front. Immunol. 14: 1223122. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,7 (WoS Q1)

* Princová J., Salat-Canela C., Daněk P., Marešová A., de Cubas L., Bähler J., Ayté J., Hidalgo E., Převorovský M. (2023): Perturbed fatty-acid metabolism is linked to localized chromatin hyperacetylation, increased stress-response gene expression and resistance to oxidative stress. PLoS Genet. 19 (1): e1010582. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,0 (WoS Q1)

Rahman W.U., Fišer R., Osička R. (2023): Kingella kingae RtxA toxin interacts with sialylated gangliosides. Microb. Pathog. 181: 106200. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,3 (WoS Q2/Q3)

Ryabchenko B., Šroller V., Horníková L., Lovtsov A., Forstová J., Huérfano S. (2023): The interactions between PML nuclear bodies and small and medium size DNA viruses. Virol. J. 20 (1): 82. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,0 (WoS Q2)

Samaké K., Novák K. (2023). Haplotype disequilibrium in the TLR genes of Czech red pied cattle. Diversity-Basel 15 (7): 811. [MDPI] IF₂₀₂₃ =  2,1 (WoS Q2/Q3)

Samoilova E., Tejnecký V., Kopecký J., Drábek O., Šťovíček A., Vokurková P., Rapoport D., Němeček K., Burešová-Faitová A., Chotěborský R., Patrmanová T., Hromasová M., Ságová‐Marečková M. (2023): The structure of microbial communities in redoximorphic microsites of Gleysol. Eur. J. Soil Sci. 74 (3): e13369. [Wiley Onliny Library] IF₂₀₂₃ =  4,0 (WoS Q2)

Smělíková E., Dřevínek P., Nyč O., Brajerová M., Tkadlec J., Krutová M. (2023): To screen or not to screen medical students for carriage of multidrug-resistant pathogens? J. Hosp. Infect. 140: 15-23. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,9 (WoS Q1)

Součková K., Jasík M., Sovadinová I., Sember A., Sychrová E., Konieczna A., Bystrý V., Dyková I., Blažek R., Lukšíková K., Pavlica T., Jankásek M., Altmanová M., Žák J., Zbončáková A., Reichard M., Slabý O. (2023): From fish to cells: Establishment of continuous cell lines from embryos of annual killifish Nothobranchius furzeri and N. kadleci. Aquat. Toxicol. 259: 106517. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,1 (WoS Q1)

Soukup J., Moško T., Kereïche S., Holada K. (2023): Large extracellular vesicles transfer more prions and infect cell culture better than small extracellular vesicles. Biochem. Biophys. Res. Commun. 687: 149208. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,5 (WoS Q3)

Szűts T., Szabó K., Zamani A., Forman M., Miller J., Oger P., Fabregat M., Kovács G., Gál J. (2023): A study in scarlet: Integrative taxonomy of the spider genus Loureedia (Araneae: Eresidae). Diversity-Basel 15 (2): 238. [MDPI] IF₂₀₂₃ =  2,1 (WoS Q2/Q3)

** Šigutová H., Šigut M., Pyszko P., Kostovčík M., Kolařík M., Drozd P. (2023): Seasonal shifts in bacterial and fungal microbiomes of leaves and associated leaf-mining larvae reveal persistence of core taxa regardless of diet. Microbiol. Spectr. 11 (1): e0316022. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,7 (WoS Q2)

Šmahel M., Nunvář J. (2023): Bioinformatics analysis of immune characteristics in tumors with alternative carcinogenesis pathways induced by human papillomaviruses. Virol. J. 20 (1): 287. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,0 (WoS Q2)

* Štach M., Pytlík R., Šmilauerová K., Rychlá J., Mucha M., Musil J., Koladiya A., Nemec M., Petráčková M., Kaštánková I., Pecherková P., Šrámková L., Polgárová K., Trněný M., Lesný P., Vydra J., Otáhal P. (2023): Characterization of the input material quality for the production of tisagenlecleucel by multiparameter flow cytometry and its relation to the clinical outcome. Pathol. Oncol. Res. 29: 1610914. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,3 (WoS Q2/Q3)

Švarcová M., Větrovský T., Kolařík M., Hubka V. (2023): Defining the relationship between phylogeny, clinical manifestation, and phenotype for Trichophyton mentagrophytes/interdigitale complex; a literature review and taxonomic recommendations. Med. Mycol. 61 (5): myad042. [Pubmed] IF₂₀₂₃ =  2,7 (WoS Q3/Q2/Q1)

* Tomasetti M., Monaco F., Strogovets O., Volpini L., Valentino M., Amati M., Neužil J., Santarelli L. (2023): ATG5 as biomarker for early detection of malignant mesothelioma. BMC Res Notes 16 (1): 61. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  1,6 (WoS Q2)

Trsová I., Hruštincová A., Krejčík Z., Kundrat D., Holoubek A., Štaflová K., Janštová L., Vaniková Š., Szikszai K., Klema J., Ryšavý P., Beličková M., Kaisrlíková M., Veselá J., Čermák J., Jonášová A., Dostál J., Frič J., Musil J., Dostálová Merkerová M. (2023): Expression of circular RNAs in myelodysplastic neoplasms and their association with mutations in the splicing factor gene SF3B1. Mol. Oncol. 17 (12): 2565-2583. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,0 (WoS Q1)

Veselská T., Švec K., Kostovčík M., Peral-Aranega E., Garcia-Fraile P., Křížková B., Havlíček V., Saati-Santamaría Z., Kolařík M. (2023): Proportions of taxa belonging to the gut core microbiome change throughout the life cycle and season of the bark beetle Ips typographus. FEMS Microbiol. Ecol. 99 (8): fiad072. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,5 (WoS Q2)

Vinkler M., Fiddaman S.R., Těšický M., O'Connor E.A., Savage A.E., Lenz T.L., Smith A.L., Kaufman J., Bolnick D.I., Davies C.S., Dedić N., Flies A.S., Samblás M.M.G., Henschen A.E., Novák K., Palomar G., Raven N., Samaké K., Slade J., Veetil N.K., Voukali E., Höglund J., Richardson D.S., Westerdahl H. (2023): Understanding the evolution of immune genes in jawed vertebrates. J. Evol .Biol. 36 (6): 847-873. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,1 (WoS Q3)

Voleníková A., Lukšíková K., Mora P., Pavlica T., Altmanová M., Štundlová J., Pelikánová Š., Simanovsky S.A., Jankásek M., Reichard M., Nguyen P., Sember A. (2023): Fast satellite DNA evolution in Nothobranchius annual killifishes. Chromosome Res. 31 (4): 33. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,4 (WoS Q3)

Vráblíková A., Brezani V., Pšíkal I., Fraiberk M., Šebela M, Fojtíková M., Kulich P., Hezová R., Mašek J. (2023): Development of modern immunization agent against bovine papillomavirus type 1 infection based on BPV1 L1 recombinant protein. Front. Vet. Sci. 10: 1116661. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,6 (WoS Q1)

Vráblíková A., Fojtíková M., Hezová R, Šimečková P., Brezani V., Straková N., Fraiberk M., Kotouček J., Mašek J., Pšíkal I. (2023): UV-C irradiation as an effective tool for sterilization of porcine chimeric VP1-PCV2bCap recombinant vaccine. Sci. Rep. 13 (1): 19337. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,8 (WoS Q1)

Původní a přehledové články v recenzovaných časopisech bez IF (v angličtině)

Šich R., Komnenov M., Trajkovska M., Just P., Střeštík V., Rückl K. (2023). New records of Larinia elegans (Araneae: Araneidae) from Czechia and North Macedonia with remarks on its ecology. Arachnol. Lett. 65 (1): 8-12. [BioOne]

Původní a přehledové články v recenzovaných časopisech bez IF (v češtině)

Bíšková J., Brychová V., Demján P., Dreslerová D., Danielisová A.F., Hošková K., John D., Koštová N., Limburský P., Molnár M., Moravcová A., Pachnerová Brabcová K., Petrová M., Světlík I., Šneberger J., Tecl J. Valášek V. (2023). Možnosti a limity radiouhlíkového datování se zaměřením na netypické archeologické vzorky. Archeologické rozhledy 75 (1): 40-67.

Němcová J., Černá K., Šíma R., Kinkorová Luňáčková I., Rob F., Martínek P., Bouda J., Šmahelová J., Ondič O. (2023): Metylačni analyza jako pomocný nástroj v cytologické diagnostice vzácnějších anogenitálních lézí – pilotní studie. Česko-slovenská patologie 1: 26-31.

Španielová H., Brdička R. (2023): Oncolytic viruses and cancer treatment. Klin. Onkol. 36 (1): 12-27. [PubMed]

Publikace na preprint serverech

Čapková Pavlíková Z., Miletínová P., Roithová A., Pospíšilová K., Záhonová K., Kachale A., Becker T., Durante I.M., Lukeš J., Paris Z., Beznosková P., Valášek L. S. (2023). Ribosomal A-site interactions with near-cognate tRNAs drive stop codon readthrough. doi: 10.1101/2023.06.19.543857. [bioRxiv]

* ... není uvedena afiliace přímo ke katedře, ale k fakultě nebo univerzitě

** ... není uvedena afiliace ani k univerzitě, ale jedná se o člena / studenta katedry genetiky a mikrobiologie PřF UK