Mejdůležitější metody

Rostliny, se kterými pracujeme:

  • kulturní plodiny (Zea mays, Hordeum vulgare, Avena sativa, Solanum lycopersicum a další)
  • modelové druhy (Arabidopsis thaliana, Brachypodium distachon a další)
  • mokřadní rostliny (např. Phragmites australis, Glyceria maxima, Acoruscalamus) a další rostliny se zajímavými fyziologickými adaptacemi

Metody anatomické analýzy vnitřní struktury rostlinného těla:

  • řezy rostlinnými objekty (ruční řezy, parafinové řezy, kryořezy), projasněné "whole-mount" preparáty
  • histochemické metody (histochemická detekce vlastností rostlinných pletiv, imunodetekce, lokalizace enzymatické aktivity na řezech)
  • mikroskopické techniky (světelná, fluorescenční, konfokální i elektronová mikroskopie)
  • cytologické metody (specifické fluorescenční sondy, vizualizace ve fixovaných i vitálních preparátech)

Zea mays - berberine + gencian violet Phragmites - lateral root Phragmites root - apoplastic tracer lateral root (SEM)


Molekulární a biochemické metody:

  • standartní metody práce s DNA a RNA (izolace, PCR, qPCR, genotypování, etc.)
  • klonování, příprava transformovaných rostlin
  • in situ lokalizace genové exprese a mitotické aktivity

detekce aktivity GUS v kořeni agarózový gel detekce mitotické aktivity (EdU barvení)


Kultivace rostlin a obrazová analýza kořenového systému:

  • kultivace rostlin na agarovém mediu, kořenové kultury in vitro
  • hydroponické kultivace rostlin, kultivace rostlin v substrátu
  • obrazová analýza kořenového systému (NIS Elements, SmartRoot, etc.)

arabidopsis in vitro