Mejdůležitější metody
Rostliny, se kterými pracujeme:
- kulturní plodiny (Zea mays, Hordeum vulgare, Avena sativa, Solanum lycopersicum a další)
- modelové druhy (Arabidopsis thaliana, Brachypodium distachon a další)
- mokřadní rostliny (např. Phragmites australis, Glyceria maxima, Acoruscalamus) a další rostliny se zajímavými fyziologickými adaptacemi
Metody anatomické analýzy vnitřní struktury rostlinného těla:
- řezy rostlinnými objekty (ruční řezy, parafinové řezy, kryořezy), projasněné "whole-mount" preparáty
- histochemické metody (histochemická detekce vlastností rostlinných pletiv, imunodetekce, lokalizace enzymatické aktivity na řezech)
- mikroskopické techniky (světelná, fluorescenční, konfokální i elektronová mikroskopie)
- cytologické metody (specifické fluorescenční sondy, vizualizace ve fixovaných i vitálních preparátech)
Molekulární a biochemické metody:
- standartní metody práce s DNA a RNA (izolace, PCR, qPCR, genotypování, etc.)
- klonování, příprava transformovaných rostlin
- in situ lokalizace genové exprese a mitotické aktivity
Kultivace rostlin a obrazová analýza kořenového systému:
- kultivace rostlin na agarovém mediu, kořenové kultury in vitro
- hydroponické kultivace rostlin, kultivace rostlin v substrátu
- obrazová analýza kořenového systému (NIS Elements, SmartRoot, etc.)