Výzkum je zaměřen na studium vztahů mezi organismy, jejich prostředím a procesy, které ovlivňují fungování ekosystémů. V rámci ekosystémové ekologie zkoumáme energetické toky, koloběhy živin a interakce mezi biotickými a abiotickými složkami přírody. V půdní ekologii se naopak zaměřujema na složení, strukturu a funkci půdy, její obyvatele (mikroorganismy, rostliny, živočichy) a jejich vliv na půdní procesy, jako je rozklad organické hmoty či ukládání uhlíku. Obě disciplíny jsou klíčové pro pochopení udržitelnosti ekosystémů, ochranu biodiverzity a efektivní hospodaření s přírodními zdroji.

 

Ekosystémová ekologie a obnova ekosystémů

  • Skupina provádí výzkum zabývající se interakcí jednotlivých složek ekosystémů a jejich změnami během primární sukcese, tyto poznatky jsou následně aplikovány do rozvoje metod obnovy těžce disturbovaných ekosystémů.
  • Intenzivní výzkum probíhá také v oblasti geochemických cyklů a jejich interakcí s ekosystémovými procesy a tvoří tak integrální součást s návrhem ekosystémové ekologie.  Hlavní náplní je studium jednotlivých biogeochemických cyklů a jejich interakcí, jako hlavního hybatele změn ve vývoji ekosystémů, a zároveň sledovnaní vlivu strukturních změn ekosystémů vyvolaných jinými faktory (př. vliv klimatického gradientu na biogeochemické cykly daných ekosystémů).  Zvláštní pozornost je věnována biogeochemickým cyklům biogenních prvků (uhlík, dusík, fosfor) ve vztahu k dalším klíčovým prvkům a přírodním podmínkám. 
  • Po stránce strukturního vývoje ekosystémů se výzkum soustředí na interakce podzemní a nadzemní části ekosystému, interakce rostlin, půdních organismů a abiotického prostředí půd a na jejich význam v dynamice vývoje ekosystémů a obnově biogeochemických cyklů.
  • Hlavním modelovým ekosystémem jsou pro nás dynamicky se rozvíjející ekosystémy po rozsáhlých disturbancích jako je těžba nerostů, zemědělská činnost či obnova oligotrofních ekosystémů metodou topsoil removal.  Tyto typy ekosystémů umožňují sledování časových změn jednak přímo, jednak pomocí chronosekvencí, tedy skupin podobných ploch různého stáří.  V současnosti se intenzivně zabýváme jak dlouhodobým sledováním několika chronosekvencí zejména na výsypkách po těžbě uhlí, tak porovnáváním vývoje ekosystémů po podobných disturbancích podél klimatických gradientů.
  • Tým: 

prof. Mgr. Ing. Jan Frouz, CSc.

RNDr. Olga Vindušková, Ph.D.

RNDr. Mgr. Ondřej Mudrák, Ph.D.

Gerrit Angst, Dr. rer. nat.

Mgr. Kateřina Jandová, Ph.D.

Mgr.. Veronika Jílková, Ph.D.

Mgr. Martin Bartuška, Ph.D.

 

SoilScope - Skupina pro studium půdní biodiverzity

  • Jsme skupina spolupracující na projektu SOB4ES, který působí na evropské úrovni. Cílem projektu je vyvinout integrovaný systém pro hodnocení vlivu půdní biodiverzity na ekosystémové služby v čase napříč různými regiony. To pomůže posoudit stav ekosystémů, zavést způsoby hospodaření šetrné k půdní biodiverzitě, stanovit cíle pro obnovu a ochranu a převést vědecké poznatky do konkrétních politických a praktických řešení.

  • Náš tým hraje v projektu SOB4ES klíčovou roli. Zaměřujeme se na sběr dat o biodiverzitě půdy, na analýzu dopadů změn ve využívání krajiny a poskytování poradenství v oblasti hospodaření s půdou.

  • Tým: 

doc. RNDr. Ladislav Miko, Ph.D.

Mgr. Ing. Andrés A. Salazar-Fillippo, Ph.D.

RNDr. Alexandra Jászayová, Ph.D.

Mgr. Petra Benetková, Ph.D.

Mgr. Věra Vtípilová

 

Publikace skupiny 2020 - 2025

Salazar-Fillippo, A. A., Emsens, W.-J., Strybos, S., Liczner, C., Miko, L., Frouz, J., Verbruggen, E., & van Diggelen, R. (2025). Effects of microarthropod density on soil fungal community composition in nutrient-poor ecosystems. Functional Ecology, 00: 1–14. https://doi.org/10.1111/1365-2435.14733

Miko, L., Kolesnikov, V. B., & Murvanidze, M. (2024). Taxonomy of European Damaeidae (Acari: Oribatida) XII. Trimetabelba Miko gen. nov. with redescription of T. propexa (Kulczynski, 1902) comb. nov. description of two new species and proposal of Prometabelba Miko gen. nov. International Journal of Acarology, 50(8), 668–686. https://doi.org/10.1080/01647954.2024.2394244

Salazar-Fillippo A. A., Tulande-M., E., Miko, L. (2024). Update of the national checklist and new records of oribatid mites (Acari: Sarcoptiformes) in conserved relicts within urban areas in Bogota D.C. (Colombia). Acarologia 64(3): 941-951. https://doi.org/10.24349/kprn-xkaq

Salazar-Fillippo, A.A., Gutiérrez-Cárdenas, P.D.A., López-Bedoya, P.A., (2024). Supernumerary presence of the oribatid mite Archegozetes sp . Grandjean , 1931 in stomach contents of the túngara frog Engystomops pustulosus ( Cope , 1864 ) encourages validation of interaction pathways : phoretic , parasitic , or prey ? International Journal of Acarology. https://doi.org/10.1080/01647954.2024.2312221

Wadoux, A. M. J.-C., Courteille, L., Arrouays, D., De Carvalho Gomes, L., Cortet, J., Creamer, R. E., Eberhardt, E., Greve, M. H., Grüneberg, E., Harhoff, R., Heuvelink, G. B. M., Krahl, I., Lagacherie, P., Miko, L., Mulder, V. L., Pásztor, L., Pieper, S., Richer-de-Forges, A. C., Sánchez-Rodríguez, A. R., … Wetterlind, J. (2024). On soil districts. Geoderma, 452, 117065. https://doi.org/10.1016/j.geoderma.2024.117065

Ermilov, S. G., Miko, L., Kolesnikov, V. B., & Salavatulin, V. M. (2023). Ontogenetic instars of the oribatid mite Spatiodamaeus kalugaensis sp. Nov. (Acari, Oribatida, Damaeidae) from Russia. Zootaxa, 5324(1), 49–65. https://doi.org/10.11646/zootaxa.5324.1.7

Jászayová, A., Režnarová, J., Chovancová, G., Kostygov, A., Yurchenko, V., Antolová, D., Zwijacz-Kozica, T., Csanády, A., Hurníková, Z. (2023). Study of Oribatid Mites as Potential Intermediate Hosts of Anoplocephalid Tapeworms of Tatra chamois and Tatra marmots from the Tatra Mountains, Central Europe, and Report of a New Intermediate Host for Andrya cuniculi, the Parasite of Leporidae. Life, 13: 955. https://doi.org/10.3390/life13040955

Salazar-Fillippo, A. A., Srinivasan, J., van der Bij, A. U., Miko, L., Frouz, J., Berg, M. P., & van Diggelen, R. (2023). Ecomorphological groups in oribatid mite communities shift with time after topsoil removal – Insight from multi-trait approaches during succession in restored heathlands. Applied Soil Ecology, 191 (June), 105046. https://doi.org/10.1016/j.apsoil.2023.105046

Benetková, P., van Diggelen, R., Háněl, L., Vicentini, F., Moradi, R., Weijters, M., Bobbink, R., Harris, J. A., & Frouz, J. (2022). Soil fauna development during heathland restoration from arable land: Role of soil modification and material transplant. Ecological Engineering, 176. https://doi.org/10.1016/j.ecoleng.2021.106531

Benetková, P., Háněl, L., & Frouz, J. (2022). Nematode Assemblages Development Twenty-One Years after the Introduction of Meadow Soil into Bare Post Mining Spoil Heap. Diversity, 14(567). https://doi.org/https://doi.org/10.3390/d14070567

Jászayová, A., Ľuptáčik, P., Csanády, A., Hurníková, Z., Chovancová, G. (2022). Biodiversity of oribatid mites (Acari: Oribatida) in the Tatra Mountains, with notes on the intermediate hosts of tapeworms. International Journal of Acarology,  48(8): 605-618.  https://doi.org/10.1080/01647954.2022.2161630

Kolesnikov, V. B., Miko, L., Marchenko, I. I., & Azimi, N. (2022). The oribatid mite subgenus Metabelba ( Pateribelba ) (Acari, Oribatida, Damaeidae): Redescription of M. (P.) filippovi and description of two new species. International Journal of Acarology, 48(7), 535–550. https://doi.org/10.1080/01647954.2022.2134922

Miko, L., Kolesnikov, V. B., Ermilov, S. G., & Klimov, P. B. (2022). Taxonomy of European Damaeidae (Acari, Oribatida) XI. European species of the genus Piribelba Miko 2021: Redescriptions of P. rossica (Bulanova-Zachvatkina, 1957) and P. piriformis (Mihelčič, 1964) using morphology and DNA sequence data, Zootaxa  (Vol. 5187, Issue 1).

Moldovan, O. T., Miko, L., Panaiotu, C., Roban, R.-D., Gąsiorowski, M., Hercman, H., Orza, R., Kenesz, M., Mirea, I. C., Petculescu, A., Robu, M., & Constantin, S. (2022). Small Human Population Drastic Impact, as Inferred From Multi-Proxies of a Temporary Carpathian Lake. Frontiers in Earth Science, 10, 856685. https://doi.org/10.3389/feart.2022.856685

Norton, R. A., Ermilov, S. G., & Miko, L. (2022). Kunstidamaeus arthurjacoti sp. Nov. (Oribatida, Damaeidae), first report of the genus in North America. Systematic and Applied Acarology. https://doi.org/10.11158/saa.27.3.7

Salazar-Fillippo, A.A., Teunkens, B., Leirs, H., Frouz, J., van Diggelen, R., Miko, L., (2022). Quantitative assessment of the dispersal of soil-dwelling oribatid mites via rodents in restored heathlands. Ecology and Evolution. 12, 1–14. https://doi.org/10.1002/ece3.9653

Salazar-Fillippo, A.A., Miko, L., (2022). Checklist of the oribatid mites (Acari: Oribatida) of the Republic of Colombia. Zootaxa 5087: 35–58. https://doi.org/10.11646/zootaxa.5087.1.2

Benetková, P., Tichý, L., Háněl, L., Kukla, J., Vicentini, F., & Frouz, J. (2020). The effect of soil and plant material transplants on vegetation and soil biota during forest restoration in a limestone quarry: A case study. Ecological Engineering, 158(August), 106039. https://doi.org/10.1016/j.ecoleng.2020.106039

Cameron, A., Boilard, G., Dubois, R., Bradley, R., Benetková, P., Józefowska, A., Thevathasan, N., Whalen, J., & Šimek, M. (2021). Distribution of earthworm communities in agroecosystems with forested riparian buffer strips: A multiscale study. Applied Soil Ecology, 167(July 2020), 104035. https://doi.org/10.1016/j.apsoil.2021.104035