2024

Publikace členů a studentů katedry v r. 2024

Údaje jsou aktuální k 14.8.2024

Původní a přehledové články v časopisech s IF

Baudyš M., Sopha H., Hodek J., Rusek J., Bartková H., Ulrychová L., Macák J.M., Weber J., Krýsa J. (2024). Inactivation of influenza virus as representative of enveloped RNA viruses on photocatalytically active nanoparticle and nanotubular TiO2 surfaces. Catalysis Today 430: 114511 [Elsevier] IF₂₀₂₃ =  5,2 (WoS Q1/Q2)

Budil J., Lišková P. (2024): Current methods for monitoring Pseudomonas syringae biofilm development. Lett. Appl. Microbiol. 77 (2): ovae013. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,0 (WoS Q3/Q4)

* Cerovská E, Šálek C., Kundrát D., Šestáková Š., Pešek A., Brožinová I., Beličková M., Remešová H. (2024): ABC transporters are predictors of treatment failure in acute myeloid leukaemia. Biomed. Pharmacother. 170: 115930. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  6,9 (WoS Q1)

Čáp M., Palková Z. (2024): Non-coding RNAs: Regulators of stress, ageing, and developmental decisions in yeast? Cells 13 (7): 599. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,1 (WoS Q2)

Čáp M., Palková Z. (2024): The characteristics of differentiated yeast subpopulations depend on their lifestyle and available nutrients. Sci. Rep. 14 (1): 3681. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,8 (WoS Q1)

Dugić M., Brzobohatá H., Mojr V., Dolejšová T., Lišková P., Do Pham D.D., Rejman D., Mikušová G., Fišer R. (2024): LEGO-lipophosphonoxins: length of hydrophobic module affects permeabilizing activity in target membranes of different phospholipid composition. RSC Adv. 14 (4): 2745-2756. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,9 (WoS Q2)

Dvořan M., Iyyappan R., Mašek T., Pospíšek M., Kubelka M., Šušor A. (2024): Assessment of active translation in cumulus-enclosed and denuded oocytes during standard in vitro maturation and early embryo development. Hum. Reprod.  39 (8): 1752-1766. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  6,0 (WoS Q1)

Erban T., Kadlečková D., Sopko B., Harant K., Talacko P., Markovič M., Saláková M., Kadlíková K., Tachezy R., Tachezy J. (2024): Varroa destructor parasitism and Deformed wing virus infection in honey bees are linked to peroxisome-induced pathways. Proteomics 24 (9): e2300312. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,4 (WoS Q2)

* Horák J., Vallusová D., Čumová A., Holý P., Vodička P., Opattová A. (2024): Inhibition of homologous recombination repair by Mirin in ovarian cancer ameliorates carboplatin therapy response in vitro. Mutagenesis doi:10.1093/mutage/gead036. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,5 (WoS Q3)

Horníková L., Henke P., Kubát P., Mosinger J. (2024): Specifically targeting capture and photoinactivation of viruses through phosphatidylcholine-ganglioside vesicles with photosensitizer. JACS Au, doi:10.1021.jacsau.4c00453 IF₂₀₂₃ =  8,5 (WoS Q1)

Hovhannisyan M., Zemánková P., Nehasil P, Matějková K., Borecká M., Černá M., Doležalová T., Dvořáková L., Foretová L., Horáčková K., Jelínková S., Just P., Kalousová M., Král J., Macháčková E., Němcová B., Šafaříková M., Springer D., Šťastná B., Tavandzis S., Vocka M., Zima T, Soukupová J., Kleiblová P., Ernst C., Kleibl Z., Janatová M. (2024): Population-specific validation and comparison of the performance of 77- and 313-variant polygenic risk scores for breast cancer risk prediction. Cancer. doi: 10.1002/cncr.35337. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  6,1 (WoS Q1)

Huber B. A., Meng G., Dederichs T. M., Michalik P., Forman M., Král J. (2024). Castaways: the Leeward Antilles endemic spider genus Papiamenta (Araneae: Pholcidae). Invertebr. Syst. 38 (2): IS23052. [CSIRO Publishing] IF₂₀₂₃ =  1,8 (WoS Q1/Q3)

Kadlečková D., Saláková M., Erban T., Tachezy R. (2024): Discovery and characterization of novel DNA viruses in Apis mellifera: expanding the honey bee virome through metagenomic analysis. mSystems 9 (4): e0008824. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,0 (WoS Q1)

* Kaisrlíková M., Kundrát D., Korálková P., Trsová I., Lenertová Z., Votavová H., Merkerová Dostálová M., Krejčík Z., Veselá J., Vostrý M., Šimečková R., Šťastná Marková M., Lauermannová M., Jonášová A., Čermák J., Divoký V., Beličková M. (2024): Attenuated cell cycle and DNA damage response transcriptome signatures and overrepresented cell adhesion processes imply accelerated progression in patients with lower-risk myelodysplastic neoplasms. Int. J. Cancer. 154 (9): 1652-1668. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,7 (WoS Q1)

Kanwal M., Poláková I., Olsen M., Kasi M. K., Tachezy R., Šmahel M. (2024): Heterogeneous response of tumor cell lines to inhibition of aspartate β-hydroxylase. J. Cancer 15 (11): 3466-3480. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,3 (WoS Q2)

Kanwal M., Šmahelová J., Číhařová B., Johari S. D., Nunvář J., Olsen M., Šmahel M. (2024): Aspartate β-hydroxylase regulates expression of Ly6 genes. J. Cancer 15 (5): 1138-1152. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,3 (WoS Q2)

Karásek L., Smetana J., Svobodová P., Šmahelová J., Tachezy R., Kiss I., Nejedlá D. (2024): Prevalence of sexually transmitted infections in women of the Czech Republic Armed Forces: a cross-sectional pilot study. BMJ Military Health. e002611. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  1,4 (WoS Q2)

Kolarczyková D., Lysková P., Švarcová M., Kuklová I., Dobiáš R., Mallátová N., Kolařík M., Hubka V. (2024): Terbinafine resistance in Trichophyton mentagrophytes and Trichophyton rubrum in the Czech Republic: A prospective multicentric study. Mycoses 67 (2): e13708. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,1 (WoS Q1/Q2)

Kleiblová P., Černá M., Zemánková P., Matějková K., Nehasil P., Hojný J., Horáčková K., Janatová M., Soukupová J., Šťastná B., Kleibl Z. (2024): Parallel DNA/RNA NGS using an identical target enrichment panel in the analysis of hereditary cancer predisposition. Folia Biol-Prague 70 (1): 62-73. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  1,1 (WoS Q3/Q4)

* Kolešová H., Hrabalová P., Bohuslavová R., Abaffy P., Fabriciová V., Sedmera D., Pavlínková G. (2024): Reprogramming of the developing heart by Hif1a-deficient sympathetic system and maternal diabetes exposure. Front. Endocrinol. 15: 1344074. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,9 (WoS Q2)

Křístková B., Martínková L., Rucká L., Kotik M,. Kulik N., Rädisch R., Winkler M., Pátek M. (2024): Immobilization of aldoxime dehydratases on metal affinity resins and use of the immobilized catalysts for the synthesis of nitriles important in fragrance industry. J. Biotechnol.  384: 12-19. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,1 (WoS Q2)

* Kvapilová K., Misenko P., Radvanszky J., Brzoň O., Budiš J., Gazdarica J., Pos O., Korabečná M., Kašný M., Szemes T., Kvapil P., Pačes J., Kozmik Z. (2024): Validated WGS and WES protocols proved saliva-derived gDNA as an equivalent to blood-derived gDNA for clinical and population genomic analyses. BMC Genomics 25 (1): 187. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,5 (WoS Q2)

* Lepesheva A., Grobarčíková M., Osičková A., Jurnečka D., Knoblochová Š., Čížková M., Osička R., Šebo P., Mašín J. (2024): Modification of the RTX domain cap by acyl chains of adapted length rules the formation of functional hemolysin pores. Biochim. Biophys. Acta - Biomembr. 1866 (5): 184311. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  2,8 (WoS Q2/Q3)

* Novotná E., Miloševic M., Pruková D., Magalhaes-Novais S., Dvořáková S., Dmytruk K., Gemperle J., Zudová D., Nickl T., Vrbacký M., Rosel D., Filimonenko V., Procházka J., Brábek J., Neužil J., Rohlenová K., Rohlena J. (2024): Mitochondrial HER2 stimulates respiration and promotes tumorigenicity. Eur. J. Clin. Invest. 54 (6): e14174. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,4 (WoS Q1/Q2)

Roučová K., Vopálenský V., Mašek T., Del Llano E., Provazník J., Landry J.J.M., Azevedo N., Ehler E., Beneš V., Pospíšek M. (2024): Loss of ADAR1 protein induces changes in small RNA landscape in hepatocytes. RNA. doi: 10.1261/rna.080097.124 [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,2 (WoS Q2)

Sabo J., Dujava Ždímalová M., Slater P.G., Dostál V., Herynek Š., Libusová L., Lowery L.A., Braun M., Lánský Z. (2024): CKAP5 enables formation of persistent actin bundles templated by dynamically instable microtubules. Curr. Biol. 34 (2): 260-272.e7. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  8,1 (WoS Q1)

Sehnal B., Halaška M. J., Vlk R., Drochýtek V., Pichlík T., Hruda M., Robová H., Rob L., Tachezy R. (2024): Human papillomavirus infection (HPV) and pregnancy. Epidemiol.  Mikrobiol. Imunol. 73 (1): 37-50. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  0,5 (WoS Q4)

* Sharma P., Maklashina E., Voehler M., Bálintová S., Dvořáková S., Kraus M., Hadrava Váňová K., Nahácka Z., Zobalová R., Boukalová Š., Čuňatová K., Mráček T., Ghayee H.K., Pacák K., Rohlena J., Neužil J., Cecchini G., Iverson T.M. (2024): Disordered-to-ordered transitions in assembly factors allow the complex II catalytic subunit to switch binding partners. Nat. Commun. 15 (1): 473. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  14,7 (WoS Q1)

* Sovilj D., Kelemen C.D., Dvořáková S., Zobalová R., Raabová H., Kříška J., Hermanová Z., Knotek T., Anděrová M., Klener P., Filimonenko V., Neužil J., Anděra L. (2024): Cell-specific modulation of mitochondrial respiration and metabolism by the pro-apoptotic Bcl-2 family members Bax and Bak. Apoptosis 9 (3-4): 424-438. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  6,1 (WoS Q1)

* Šestáková Š., Šálek C., Kundrát D., Cerovská E., Vydra J., Ježíšková I., Folta A., Mayer J., Cetkovský P., Remešová H. (2024): MethScore as a new comprehensive DNA methylation-based value refining the prognosis in acute myeloid leukemia. Clin. Epigenetics 16 (1): 7. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,8 (WoS Q1)

Šmahelová J., Pokrývková B., Šťovíčková E., Grega M., Vencálek O., Šmahel M., Koucký V., Maléřová S., Klozar J., Tachezy R. (2024): Aspartate-β-hydroxylase and hypoxia marker expression in head and neck carcinomas: implications for HPV-associated tumors. Infect. Agents Cancer. 19 (1): 26. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  3,1 (WoS Q2/Q3)

Šmíd M., Tuček V., Maďar R., Tachezy R., Hel Z. (2024): No evidence of a “healthy vaccinee effect” in COVID-19 vaccination data from the Czech Republic. Int. J. Infect. Dis. 146: 107144. IF₂₀₂₃ =  4,8 (WoS Q1)

Váchová L., Plocek V., Maršíková J., Rešetárová S., Hatáková L., Palková Z. (2024): Differential stability of Gcn4p controls its cell-specific activity in differentiated yeast colonies. mBio 15 (5): e0068924. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,1 (WoS Q1)

Vaňková Hausnerová V., Shoman M., Kumar D., Schwarz M., Modrák M., Jirát Matějčková J., Mikesková E., Neva S., Herrmannová A., Šiková M., Halada P., Novotná I., Pajer P., Valášek L.S., Převorovský M., Krásný L., Hnilicová J. (2024): RIP-seq reveals RNAs that interact with RNA polymerase and primary sigma factors in bacteria. Nucleic Acids Res. 52 (8): 4604-4626. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  16,6 (WoS Q1)

Vránová L., Poláková I., Vaníková Š., Saláková M., Musil J., Vaníčková M., Vencálek O., Holub M., Bohoněk M., Řezáč D., Dresler J., Tachezy R., Šmahel M. (2024): Multiparametric analysis of the specific immune response against SARS-CoV-2. Infect. Dis. doi:10.1080/23744235.2024.2358379 [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,0 (WoS Q1)

Vrbata D., Červený J., Kulik N., Hovorková M., Balogová S., Vlachová M., Pelantová H., Křen V., Bojarová P. (2024): Glycomimetic inhibitors of tandem-repeat galectins: Simple and efficient. Bioorg. Chem. 145: 107231. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,5 (WoS Q1)

* Zavala-Meneses S.G., Firrincieli A., Chalová P., Pajer P., Checcucci A., Skultéty L., Cappelletti M. (2024): Proteogenomic characterization of Pseudomonas veronii SM-20 growing on phenanthrene as only carbon and energy source. Microorganisms 12 (4): 753. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  4,1 (WoS Q2)

Zemánková P., Černá M., Horáčková K., Ernst C., Soukupová J., Borecká M., Blümcke B., Černá L., Černá M., Curtisová V., Doležalová T., Dušková P., Dvořáková L., Foretová L., Havránek O., Hauke J., Hahnen E., Hodulová M., Hovhannisyan M., Hrušková L., Janatová M., Janíková M., Jelínková S., Just P., Kosařová M., Koudová M., Krutílková V., Macháčková E., Matějková K., Michalovská R., Mišove A., Nehasil P., Němcová B., Novotný J., Panczak A., Pesek P., Scheinost O., Springer D., Šťastná B., Stránecký V., Šubrt I., Tavandzis S., Turečková E., Veselá K., Vlčková Z., Vočka M., Wappenschmidt B., Zima T., Kleibl Z., Kleiblová P. (2024): A deep intronic recurrent CHEK2 variant c.1009-118_1009-87delinsC affects pre-mRNA splicing and contributes to hereditary breast cancer predisposition. Breast 75: 103721. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,7 (WoS Q1)

Žáčková S., Pávová M., Trylčová J., Chalupová J., Priss A., Lukšan O., Weber J. (2024). Upregulation of mRNA expression of ADGRD1/GPR133 and ADGRG7/GPR128 in SARS-CoV-2-infected lung adenocarcinoma Calu-3 cells. Cells 13 (10): 791. [PubMed] IF₂₀₂₃ =  5,1 (WoS Q2)

Kapitoly v knihách

Mutabdžija L., Myoli A., de Jonge N. F., Damiani T., Schmid R., van der Hooft J. J. J., Tugizimana F., Pluskal T. (2024): Studying plant specialized metabolites using computational metabolomics strategies. In: Maghuly, F. (ed): Plant Functional Genomics. Methods in Molecular Biology 2788. Humana, New York, NY, pp. 97-136. [PubMed]

Původní a přehledové články v recenzovaných časopisech bez IF (v angličtině)

Šneberger J., Tejček M., Lungová V. (2024): The positive identification of skeletal remains from the church of the Assumption of the Virgin Mary in Přeštice: a case study. Interdisciplinaria Archaeologica 15 (1): doi: 10.24916/iansa.2024.1.3

Publikace na preprint serverech

Hospodářská M., Mora P., Voleníková A. C., Al-Rikabi A., Šimanovský S. A., Pavlica T., Altmanová M., Janečková K., Štundlová J., Tolar N., Jankášek M., Hiřman M., Liehr T., Reichard M., Krysanov E. Y., Ráb P., Englert C., Nguyen P., Sember A. (2024). Sex chromosome turnover in African annual killifishes of the genus Nothobranchius. doi: 10.1101/2024.03.25.586567. [bioRxiv]

Šmahel M., Johari S.D., Šmahelová J., Pfeiferová L., Nunvář J. (2024): Drivers of spatial immune heterogeneity in a mouse tumor model after immunotherapy. doi: 10.2139/ssrn.4855460 [SSRN] 

Šúri T., Pfeiferová L., Bezdíček M., Svatoň J., Hampl V., Berka K., Jiřincová H., Lengerová M., Kolísko M., Nagy A., Tachezy R., Kolář M., Pačes J. (2024). Developing molecular surveillance of SARS-CoV-2 in the Czech Republic (2021–2022). doi: 10.22541/au.171298443.37055632/v1 [Authorea Preprints]

* ... není uvedena afiliace přímo ke katedře, ale k fakultě nebo univerzitě

** ... není uvedena afiliace ani k univerzitě, ale jedná se o člena / studenta katedry genetiky a mikrobiologie PřF UK