Teoretická biologie a filosofie biologie

Teoretická biologie je jedním z hlavních zaměření naší katedry a většinou je definována jako vědní obor zaměřující se na použití matematických modelů, abstraktních konceptů a simulací k pochopení biologických procesů a systémů. Namísto přímého experimentování s živými organismy se teoretická biologie snaží vysvětlit biologické jevy na základě teoretických principů, často čerpajících z jiných vědních oborů jako je fyzika, chemie, informatika, lingvistika či filosofie. Tento přístup umožňuje vědcům popisovat a analyzovat složité dynamiky v ekosystémech, evoluční procesy, nebo fungování buněk, čímž přispívá k hlubšímu porozumění životu na různých úrovních organizace. V rámci naší skupiny se teoretická biologie do velké míry se překrývá i s tzv. filosofií biologie, která se zabývá zkoumáním základních filosofických otázek souvisejících s biologií či naším pojímáním živého. Zahrnuje témata jako jsou hranice živého a neživého, vznik života, evoluční teorie, koncept biologického druhu, různé typy dědičnosti, studium organismální agency a mnoho dalších témat. Filosofie biologie se tak ptá, jaké jsou hranice mezi živým a neživým, jaké jsou cesty biologické evoluce či míra uplatňování mechanismu či determinismu v organismálních procesech. Ptá se i po povaze metafyziky vědy o živém, jejích důsledcích a případných nedostatcích.

Členové skupiny:

  • doc. RNDr. Anton Markoš, CSc. – buněčná, vývojová a evoluční biologie; biosémiotika, zejm. průniky mezi historickými a teoretickými vědami.
  • Mgr. Jana Švorcová, Ph.D. – filosofie biologie, vlivy negenetické variability a dědičnosti na evoluci organismů, organické paměti, organismální agency, procesuální filosofie a biosémiotika.
  • Mgr. Jan Toman, Ph.D. – makroevoluce, evoluce evolvability, modularita a hierarchická komplexita, třídění z hlediska stability a jeho role v evoluci, teorie zamrzlé evoluce, evoluce pohlavního rozmnožování.

Doktorandi:

  • Mgr. Matěj Jureček – vznik života, chemická evoluce, protobiologie, syntetická biologie, filosofie biologie.
  • Thor van Walsum, MSc. – biosémiotika, filosofie biologie, invazivita druhů a ekologie.

Magisterští studenti:

  • Kristýna Coufalová – epigenetika, mikrobiální interakce.

Seminář z teoretické biologie

Každý čtvrtek (oba semestry) od 15:30 probíhá na katedře Seminář z teoretické biologie (MS720S25Z), kde se probírají témata všech našich pracovních skupin. Seminář probíhá v angličtině.

Důležité projekty:

  • 3/2024–3/2027: Holistické náhledy na živou přírodu ve světle moderní biologie, Grantová agentura Univerzity Karlovy, č. 122824 (Mgr. Matěj Jureček jako hlavní řešitel).
  • 1/2021–12/2023: Contemporary Philosophy of Biology: Organism as an Agent. Czech Science Foundation, č. 20-16633S (Jana Švorcová jako řešitel).
  • 1/2018–12/2023: Nature and Culture: Historical, Cultural, and Biological Concepts of Human Nature. Charles University Research Centre programme č. 204056 (členové týmu).

Domácí spolupráce:

  • Fakulta humanitních studií, Univerzita Palackého v Olomouci, Centrum teoretických studií.

Zahraniční spolupráce:

  • Distributed Language Group at the University of Southern Denmark (Stephen Cowley);
  • Department of Semiotics at the University of Tartu, Estonia (Kalevi Kull, Riin Magnus, Nelly Mäekivi);
  • School of Natural Sciences and Health, Tallinn University, Estonia (Andres Kurismaa);
  • Complexity Science Hub, Vienna, Austria (Johannes Jaeger);
  • Department of Philosophy, University of Dundee, Scotland (T. Röck);
  • Technical University, Berlin, Germany (S. Koutroufinis).

Vybrané publikace:

  • Markoš A and Švorcová J (2019) Epigenetic Processes and the Evolution of Life. CRC Press, Taylor and Francis, Boca Raton.
  • Ovčáčková L, Švorcová J (2024) Metaphysics of the Organic Whole: Ehrenfels, Uexküll, and Merleau-Ponty. Biosemiotics 17, 341–360.
  • Švorcová J (ed.) (2024) Organismal Agency. Biological Concepts and Their Philosophical Foundations. Springer.
  • Švorcová J, Štěrbová Z, Jacques J, Havlíček J, Hampl P & Fulínová E (2024) Sex – Gender – Procreation. With a Few Remarks on Gender. Pavel Mervart, Červený Kostelec.
  • Švorcová J, Lacková L, Fulínová E (2023) Evolution by Habit: Peirce, Lamarck and Teleology in Biology. Theory in Biosciences 142, 411–422.
  • Švorcová J, Markoš A (2023) Closures as a Precondition of Life, Agency, and Semiosis, Biosemiotics (16)1, 45–59.
  • Toman J (2020) Evoluce3: Evolutionary Trends, Evolvability, and the Frozen Evolution Theory. Academia.
  • Toman J, Flegr J (2017) Stability-based Sorting: The Forgotten Process Behind (Not Only) Biological Evolution. Journal of Theoretical Biology 435: 29-41.

Témata závěrečných prací:

Bude doplněno.