Seznam hlavních metod používaných v naší laboratoři.

Terénní výzkum

  • Výběr stanovišť podle kritérií výzkumu

  • Charakterizace mikrolimatu (teplota, vlhkost - pomocí senzorů a dataloggerů)

  • Charakterizace vybraných reprezentativních jedinců - morfologické a růstové parametry

  • Odběr vzorků listoví v terénu pro laboratorní analýzy

  • In-situ měření fyziologických procesů (např. fluorescence, reflektance, fotosyntéza, transpirace pomocí přenosných přístrojů)

Kultivace rostlinného materiálu

  • Hydro/aeroponická kultivace a jímání kořenových exudátů - zavádíme
  • Nádobové experimenty (sucho, zaplavení) ve skleníku a na pozemku experimentální zahrady KEBR
  • Pěstování v kultivačních boxech

“Klasické” metody rostlinné fyziologie

  • Strukturální funkční znaky

    • obsah vody a sušiny
    • listová plocha
    • specifická listová hmotnost
  • Měření výměny plynů - fotosyntéza, transpirace (LI-6400XT IRGA - IR gazometrický systém)
  • Měření vodního potenciálu v tlakové komoře (PMS 600D)
  • Rychlá kinetika fluorescence chlorofylu (kapesní Fluorpen FluorPen FP 110/D)
  • Optické měření fotosyntetických a ochranných pigmentů příručními přístroji
    • MPM-300 (chlorofyl, antokyany, flavonoidy)
    • SPAD-502 (chlorofyl)
    • MultispeQ (chlorofyl, parametry primární fáze fotosyntézy)
    • CCM-300 (chlorofyl fluorescenčně)

Laboratorní spektroskopie - optické vlastnosti listoví

  • Spektroradiometr ASD FieldSpec v kombinaci s:
    • kontaktní sondou (odrazivost)
    • integrační sférou (odrazivost a propustnost)
    • speciálními držáky vlastní výroby (3D tisk)
    • zpracování spektrálních dat (vegetační indexy, vícerozměrné analýzy)

Anatomická mikrotechnika, mikroskopie, histochemie a zpracování obrazu

  • Příprava řezů pro mikroskopii - ruční řezy, řezy na mikrotomu

  • Světelná a fluorescenční mikroskopie, případně konfokální mikroskopie

  • Histochemické detekce (např. sekundárních metabolitů) a jejich analýza
  • Snímání obrazu, vytváření mikrofotografií rostlinných struktur
  • Analýza obrazu (ImageJ, Ilastik), stereologické metody pro zpracování anatomických a histochemických řezů

Termografie

  • Zjišťování teplotních map porostu, rostlin pro ekofyziologické analýzy - určení fyziologického stavu a stresu rostlin
    • HIKMICRO M60 termokamera - zavádíme

Biochemické analýzy laboratorní spektrofotometrie

V laboratoři máme spektrofotometr UV-VIS Evolution 201

  • Fotosyntetické a ochranné pigmenty
  • Rozpustné fenolické látky, taniny
  • Lignin, celulóza
  • Prolin

Zpracování dat

  • Statistické analýzy včetně zpracování vícerozměrných dat v R, Excel

Prezentace dat

  • Pro studenty instruktáže jak prezentovat výsledky pro různé účely