Výzkumné zaměření Limnologie, paleolimnologie a hydrobiologie zahrnuje komplexní výzkum vodních ekosystémů za účelem porozumění jejich současné i dlouhodobé dynamice a zlepšení jejich ochrany. Pozornost je věnována dopadům antropogenních vlivů na oživení povrchových vod, změnám diverzity vodní bezobratlé fauny v reakci na environmentální změny a ekologii bioindikačně významných taxonů. Vodní organismy jsou studovány v kontextu změn v povodích vodních těles a klimatických změn. Některé z aktivit spojených s tímto výzkumným zaměřením se odehrávají na Hydrobiologické stanici Velký Pálenec na Blatensku (založena r. 1924 prof. Karlem Schäffernou), která je detašovaným pracovištěm Ústavu pro životní prostředí.
Paleolimnologie a ekologie horských jezer
- Multi-proxy výzkum jezerních sedimentů; rekonstrukce environmentálních změn v pozdním glaciálu a holocénu; vývoj ekosystémů typu jezero-povodí; ekologie a diverzita bezobratlých živočichů v horských jezerech a nádržích
-
Hlavní modelové taxony: pakomárovití (Chironomidae), perloočky (Cladocera/ Diplostraca), klanonožci (Copepoda), vířníci (Rotifera)
- Tým:
Limnologie a hydrobiologie
- měření morfometrických a hydrologických parametrů nádrží, odběrové metody a zařízení pro odběr baktérií, fytoplanktonu, zooplanktonu a bentosu; chemické metody (stanovení rozpuštěných plynů, hlavních iontů, rozpuštěných organických látek a některých kovů)
- limnologiue stojatých a tekoucích vod, fungování sladkovodních ekosystémů, ekologie sladkovodních organismů, studium specifických adaptací organismů na různé typy sladkovodních biotopů
- Tým: