Proteolýza je zásadním krokem pro zpracování vzorků v hmotnostně spektrometrické analýze proteinů, jejich modifikací i strukturních aspektů (tzv. strukturní proteomika). Tým z centra BioCeV, jehož součástí byli i členové naší katedry Zuzana Kalaninová, Jasmína Mária Portašiková, Barbora Jirečková, Marek Polák a Petr Novák, nově odhalil, že významná skupina enzymů, považovaná za specifickou vůči štěpení za prolinem a alaninem (PPCEs – z angl. Post-Proline Cleaving Enzymes), má selektivitu i k redukovanému cysteinu. Jedná se o proteázy z kropidláku černého (Aspergillus niger). Již samotné štěpení za prolinem činí tyto enzymy velmi významným proteolytickým nástrojem, neboť prolin je pro jiné enzymy tzv. zakázanou aminokyselinou, která se nesmí vyskytovat v okolí štěpeného místa. Selektivita vůči redukovanému cysteinu pak pro PPCEs otevírá zcela nové pole využití – např. pro analýzu zapojení disulfidových můstků či modifikaci cysteinů. Tím ale dopad toho objevu nekončí. PPCEs hrají významnou roli v regulaci biologických procesů (dipeptidyl peptidasy, kathepsin) nebo v terapii glutenových intolerancí a celiakie.
Celý článek: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.4c04277