Na katedře botaniky probíhá výzkum především v těchto okruzích:
Algologie
- Viz https://botany.natur.cuni.cz/algo/vyzkum.html
- Ekologie fytobentosu v rašeliništích
- Taxonomie, ekologie a biodiverzita chrysomonád
- Ekologie terestrických biofilmů
- Fenotypická plasticita a geometrická morfometrika mikrořas
- Ekofyziologie a stresová tolerance zelených řas
- Taxonomie a fylogenetika zelených aerofytických řas
- Evoluce a kryptická diverzita krásivek
- Molekulární diverzita a evoluce zlativek
- Druhový koncept, diverzita a ekologie lišejníkových fotobiontů
- Molekulární fylogenetika a ekologie rozsivek
- Pavel Škaloud skaloud@natur.cuni.cz
- Jiří Neustupa, Yvonne Němcová, Jana Kulichová, Jan Šťastný, Martina Pichrtová
Mykologie
- Viz https://botany.natur.cuni.cz/myko/index.research.html
- Endofytní houby listnatých dřevin
- Taxonomie a ekologie rzí
- Ekologie půdních hub na odkalištích a na extrémních stanovištích
- Biodiverzita pyrenomycetů
- Ekologie hub v jehličnatém opadu
- Diverzita a ekologie hub žijících v symbiózách s podkorním hmyzem
- Diverzita půdních hub na přirozených stanovištích (např. Šumava, Krkonoše)
- Ondřej Koukol ondrej.koukol@natur.cuni.cz
Populační ekologie
- dynamika rostlinných populací, role jednotlivých složek jejich životního cyklu
- šíření rostlin v krajině a metapopulační dynamika, jak se rostliny vyrovnávají s měnící se krajinou
- interakce rostlin a opylovačů, herbivorů a patogenů a jejich vliv na život rostlin
- populační biologie invazních rostlin: hledání slabých míst v jejich životním cyklu pro jejich cílený management
- Zuzana Münzbergová zuzmun@natur.cuni.cz
- Tomáš Koubek, Tomáš Herben
Ochranářská biologie
- management přírodovědecky cenných území (kosení, pastva) a jeho vliv na biodiverzitu, návrhy managementových programů v chráněných územích
- cílená ochrana vzácných druhů: znalost jejich populační biologie a genetiky jako předpoklad pro úspěšnou ochranu
- Zuzana Münzbergová zuzmun@natur.cuni.cz
- Hana Mayerová, Věra Hadincová
Experimentální a evoluční ekologie
- chování rostlin a fenotypická plasticita: jak rostliny reagují na své sousedy, na herbivory a patogeny a na měnící se vnější prostředí
- vzájemné vztahy rostlinných jedinců v kompetici
- vegetativní/klonální růst jako klíčový životní projev rostlin, jeho možnosti a vztah k prostředí
- Martin Weiser weiser2@natur.cuni.cz
- Tomáš Koubek, Tomáš Herben
Historie a dynamika vegetace a krajiny
- lesní vegetace a její dynamika, vliv lesního hospodaření dnes a v minulosti
- jak dnešní vegetace odráží strukturu krajiny v minulosti, krajinná paměť a vegetace, využití historických map, starých leteckých snímků, paleoekologických dat, archivních záznamů
- sukcese v moderní krajině za poslední století, zpracování starých vegetačních záznamů, map a půdních analýz jako unkátních informací o minulé vegetaci, sukcese a obnova krajiny
- Pavel Kovář kovar@natur.cuni.cz
Tropická ekologie
- ekologie jihoamerických parámos, příčiny jejich biodiverzity, evoluce a fylogeneze modelových skupin páramos
- fyziologická ekologie horských tropických rostlin, adaptace na teplotní extrémy
- Petr Sklenář petr@natur.cuni.cz
- Diana Libeth Aparicio Vásquez
Kvartérní paleoekologie
- dlouhodobá dynamika vegetace a kvantitativní rekonstrukce půdního krytu (land cover) v minulosti
- vliv změn klimatu a disturbance (požárů, land use) na vegetaci
- pylová analýza, rostlinné makrozbytky, analýza uhlíků, a další
- Petr Kuneš petr@kunes.net
- Petr Pokorný, Vojtěch Abraham, Přemysl Bobek
Biosystematika a evoluce rostlin
- Biosystematické studie polyploidních kompexů. Cílem projektů je nahlédnout do variability polyploidních skupin na různých hierarchických úrovních a poznat příčiny a důsledky této variability. Zabýváme se otázkami morfologické a ekologické diferenciace, geografického rozšíření, reprodukčních způsobů i vnitro- a mezipopulační genetické variability. Při studiu jsou používány soubory molekulárních technik, morfometrická hodnocení a cytometrické postupy.
- Evoluční dynamika polyploidních skupin, procesy ve smíšených populacích více cytotypů. Cílem projektů je odhalit, jakou roli hrají vybrané mikroevoluční procesy při vzniku, uchycení a dalším šíření polyploidních taxonů. Zkoumána je role neredukovaných gamet, vznik a účinnost reprodukčně-izolačních mechanismů, stanovištní diferenciace, otázky vzájemného ovlivňování cytotypů (hybridizace, kompetice) a jejich interakcí s dalšími skupinami organismů (opylovači, herbivoři, mykorhizní houby). Zvláštní pozornost je věnována sympatrickým diploidně-polyploidním populacím, které představují počáteční stav v evoluci většiny polyploidů. Mezi nejčastější metodické přístupy patří cytometrické techniky, experimentální postupy a ekologická a fenologická pozorování
- Fylogeografie polyploidních komplexů
- Tomáš Urfus urfus@natur.cuni.cz
Výzkumné zaměření - hlavní obory rozvíjené na Katedře botaniky
- Ekologie, rozšíření, diverzita a taxonomie saprotrofních a parazitických hub, lišejníků a mechorostů v přirozených i umělých, antropicky zatížených ekosystémech.
- Role saprotrofních hub při dekompozici opadu a koloběhu živin v ekosystému.
- Mikroskopické houby významné v prostředí člověka, v potravinářství a ve zdravotnictví (alergenní mikromycety, klinicky významné houby).
- Interakce mikroskopických hub s jinými mikroorganismy (krytenky), členovci (pancířníci, dřevokazný hmyz) a dřevinami.
- Morfologie, taxonomie a ontogeneze vybraných skupin řas.
- Molekulární fylogenetika zelených řas.
- Ekologie a rozšíření planktonních a bentických řasových populací stojatých i tekoucích sladkých vod; ekologie synuzií půdních a aerických sinic a řas.
- Geometrická morfometrika v ekologii zelených řas a chrysomonád.
- Polyploidie a její role v evoluci cévnatých rostlin.
- Populační dynamika polyploidních komplexů.
- Mikroevoluční procesy v sympatických populacích různých cytotypů.
- Genetická variabilita vzácných a ohrožených druhů cévnatých rostlin.
- Apomiktické komplexy.
- Biosystematické studie cévnatých rostlin, s důrazem na zástupce střední Evropy a Středomoří.
- Fylogeografie a studium šíření.
- Fytogeografie území ČR.
- Morfologie cévnatých rostlin.
- Struktura, klasifikace a dynamika moderní vegetace.
- Změny vegetace v historické době.
- Dynamika ekosystémů v záplavových zónách řek.
- Populační biologie druhů a její role pro přežití druhů v krajině.
- Genetická variabilita rostlin ve vztahu k ekologii.
- Mechanismy určující druhovou bohatost rostlinných společenstev.
- Vztahy mezi rostlinami a živočichy, a dalšími skupinami organismů.
- Paleoekologie a archeobotanika středoevropské krajiny.
- Populační biologie vzácných a mizejících druhů naší květeny.
- Ekologie invazních druhů rostlin.
- Kolonizace a sukcese na nově vzniklých stanovištích.
- Tropická ekologie.