Na katedře botaniky probíhá výzkum především v těchto okruzích:

Algologie

  • Viz https://botany.natur.cuni.cz/algo/vyzkum.html
  • Ekologie fytobentosu v rašeliništích
  • Taxonomie, ekologie a biodiverzita chrysomonád
  • Ekologie terestrických biofilmů
  • Fenotypická plasticita a geometrická morfometrika mikrořas
  • Ekofyziologie a stresová tolerance zelených řas
  • Taxonomie a fylogenetika zelených aerofytických řas
  • Evoluce a kryptická diverzita krásivek
  • Molekulární diverzita a evoluce zlativek
  • Druhový koncept, diverzita a ekologie lišejníkových fotobiontů
  • Molekulární fylogenetika a ekologie rozsivek
  • Pavel Škaloud skaloud@natur.cuni.cz
  • Jiří Neustupa, Yvonne Němcová, Jana Kulichová, Jan Šťastný, Martina Pichrtová

Mykologie

  • Viz https://botany.natur.cuni.cz/myko/index.research.html
  • Endofytní houby listnatých dřevin
  • Taxonomie a ekologie rzí
  • Ekologie půdních hub na odkalištích a na extrémních stanovištích
  • Biodiverzita pyrenomycetů
  • Ekologie hub v jehličnatém opadu
  • Diverzita a ekologie hub žijících v symbiózách s podkorním hmyzem
  • Diverzita půdních hub na přirozených stanovištích (např. Šumava, Krkonoše)
  • Ondřej Koukol ondrej.koukol@natur.cuni.cz

Populační ekologie

  • dynamika rostlinných populací, role jednotlivých složek jejich životního cyklu
  • šíření rostlin v krajině a metapopulační dynamika, jak se rostliny vyrovnávají s měnící se krajinou
  • interakce rostlin a opylovačů, herbivorů a patogenů a jejich vliv na život rostlin
  • populační biologie invazních rostlin: hledání slabých míst v jejich životním cyklu pro jejich cílený management
  • Zuzana Münzbergová zuzmun@natur.cuni.cz
  • Tomáš Koubek, Tomáš Herben

Ochranářská biologie

  • management přírodovědecky cenných území (kosení, pastva) a jeho vliv na biodiverzitu, návrhy managementových programů v chráněných územích
  • cílená ochrana vzácných druhů: znalost jejich populační biologie a genetiky jako předpoklad pro úspěšnou ochranu
  • Zuzana Münzbergová zuzmun@natur.cuni.cz
  • Hana Mayerová, Věra Hadincová

Experimentální a evoluční ekologie

  • chování rostlin a fenotypická plasticita: jak rostliny reagují na své sousedy, na herbivory a patogeny a na měnící se vnější prostředí
  • vzájemné vztahy rostlinných jedinců v kompetici
  • vegetativní/klonální růst jako klíčový životní projev rostlin, jeho možnosti a vztah k prostředí
  • Martin Weiser weiser2@natur.cuni.cz
  • Tomáš Koubek, Tomáš Herben

Historie a dynamika vegetace a krajiny

  • lesní vegetace a její dynamika, vliv lesního hospodaření dnes a v minulosti
  • jak dnešní vegetace odráží strukturu krajiny v minulosti, krajinná paměť a vegetace, využití historických map, starých leteckých snímků, paleoekologických dat, archivních záznamů
  • sukcese v moderní krajině za poslední století, zpracování starých vegetačních záznamů, map a půdních analýz jako unkátních informací o minulé vegetaci, sukcese a obnova krajiny
  • Pavel Kovář kovar@natur.cuni.cz

Tropická ekologie

  • ekologie jihoamerických parámos, příčiny jejich biodiverzity, evoluce a fylogeneze modelových skupin páramos
  • fyziologická ekologie horských tropických rostlin, adaptace na teplotní extrémy
  • Petr Sklenář petr@natur.cuni.cz
  • Diana Libeth Aparicio Vásquez

Kvartérní paleoekologie

  • dlouhodobá dynamika vegetace a kvantitativní rekonstrukce půdního krytu (land cover) v minulosti
  • vliv změn klimatu a disturbance (požárů, land use) na vegetaci
  • pylová analýza, rostlinné makrozbytky, analýza uhlíků, a další
  • Petr Kuneš petr@kunes.net
  • Petr Pokorný, Vojtěch Abraham, Přemysl Bobek

Biosystematika a evoluce rostlin

  • Biosystematické studie polyploidních kompexů. Cílem projektů je nahlédnout do variability polyploidních skupin na různých hierarchických úrovních a poznat příčiny a důsledky této variability. Zabýváme se otázkami morfologické a ekologické diferenciace, geografického rozšíření, reprodukčních způsobů i vnitro- a mezipopulační genetické variability. Při studiu jsou používány soubory molekulárních technik, morfometrická hodnocení a cytometrické postupy.
  • Evoluční dynamika polyploidních skupin, procesy ve smíšených populacích více cytotypů. Cílem projektů je odhalit, jakou roli hrají vybrané mikroevoluční procesy při vzniku, uchycení a dalším šíření polyploidních taxonů. Zkoumána je role neredukovaných gamet, vznik a účinnost reprodukčně-izolačních mechanismů, stanovištní diferenciace, otázky vzájemného ovlivňování cytotypů (hybridizace, kompetice) a jejich interakcí s dalšími skupinami organismů (opylovači, herbivoři, mykorhizní houby). Zvláštní pozornost je věnována sympatrickým diploidně-polyploidním populacím, které představují počáteční stav v evoluci většiny polyploidů. Mezi nejčastější metodické přístupy patří cytometrické techniky, experimentální postupy a ekologická a fenologická pozorování
  • Fylogeografie polyploidních komplexů
  • Tomáš Urfus urfus@natur.cuni.cz

Výzkumné zaměření - hlavní obory rozvíjené na Katedře botaniky

  • Ekologie, rozšíření, diverzita a taxonomie saprotrofních a parazitických hub, lišejníků a mechorostů v přirozených i umělých, antropicky zatížených ekosystémech.
  • Role saprotrofních hub při dekompozici opadu a koloběhu živin v ekosystému.
  • Mikroskopické houby významné v prostředí člověka, v potravinářství a ve zdravotnictví (alergenní mikromycety, klinicky významné houby).
  • Interakce mikroskopických hub s jinými mikroorganismy (krytenky), členovci (pancířníci, dřevokazný hmyz) a dřevinami.
  • Morfologie, taxonomie a ontogeneze vybraných skupin řas.
  • Molekulární fylogenetika zelených řas.
  • Ekologie a rozšíření planktonních a bentických řasových populací stojatých i tekoucích sladkých vod; ekologie synuzií půdních a aerických sinic a řas.
  • Geometrická morfometrika v ekologii zelených řas a chrysomonád.
  • Polyploidie a její role v evoluci cévnatých rostlin.
  • Populační dynamika polyploidních komplexů.
  • Mikroevoluční procesy v sympatických populacích různých cytotypů.
  • Genetická variabilita vzácných a ohrožených druhů cévnatých rostlin.
  • Apomiktické komplexy.
  • Biosystematické studie cévnatých rostlin, s důrazem na zástupce střední Evropy a Středomoří.
  • Fylogeografie a studium šíření.
  • Fytogeografie území ČR.
  • Morfologie cévnatých rostlin.
  • Struktura, klasifikace a dynamika moderní vegetace.
  • Změny vegetace v historické době.
  • Dynamika ekosystémů v záplavových zónách řek.
  • Populační biologie druhů a její role pro přežití druhů v krajině.
  • Genetická variabilita rostlin ve vztahu k ekologii.
  • Mechanismy určující druhovou bohatost rostlinných společenstev.
  • Vztahy mezi rostlinami a živočichy, a dalšími skupinami organismů.
  • Paleoekologie a archeobotanika středoevropské krajiny.
  • Populační biologie vzácných a mizejících druhů naší květeny.
  • Ekologie invazních druhů rostlin.
  • Kolonizace a sukcese na nově vzniklých stanovištích.
  • Tropická ekologie.