Atlasy mikroskopických hub - fotodokumentace kmenů CCF
Odborní pracovníci CCF
- RNDr. Alena Kubátová, CSc. – kurátorka CCF (Ascomycota, Eurotiales, Hypocreales aj.)
- MUDr. Mgr. Vít Hubka, Ph.D. (Aspergillus, houby z klinických substrátů, molekulární analýza)
- doc. Mgr. Ondřej Koukol, Ph.D. (ekologie hub, houby opadu, molekulární analýza)
- Mgr. Miroslav Kolařík, Ph.D. (fylogenetika, houby asociované s hmyzem)
Technické pracovnice CCF
- Lada Syrovátková
- Kateřina Glässnerová
- Ivana Borovičková
Informace o CCF
- Zaměření: Převážně saprotrofní askomycety a zygomycety (např. půdní houby, dekompozitoři, entomopatogenní houby, fytopatogeni, kontaminanty potravin, oportunní patogeni člověka, aj.).
- Počet kultur: V současnosti sbírka uchovává přes 4900 kmenů hub; cca 3500 je přístupných pro veřejnost.
- Historie: Založení v letech 1964-65 dr. Olgou Fassatiovou. Přijetí do Světové federace sbírek kultur (WFCC) roku 1972 pod registr. č. 182. Vstup do Evropské organizace sbírek kultur (ECCO) roku 1985.
- Současnost: CCF slouží pro výuku mykologů, uchovává dokladový materiál, poskytuje srovnávací materiál pro taxonomickou práci vědeckých pracovníků a studentů katedry botaniky, poskytuje své kmeny i dalším výukovým a výzkumným institucím.
- Metody uchovávání: ve zkumavkách na šikmých agarových médiích v chladničce při cca 5 °C, v lyofilizované formě, pod minerálním olejem při cca 5 °C a některé v alginátových peletách při cca 5 °C. Nejvýznamnější kmeny (např. ex-typové kultury) jsou uchovávány v tekutém dusíku.
- Katalog: Poslední Katalog CCF byl vydán roku 2003, na vyžádání může být zdarma poskytnut.
- Od roku 2006 působí CCF v „Národním programu genetických zdrojů mikroorganismů a drobných živočichů hospodářského významu (NPGZM)“ podporovaného Ministerstvem zemědělství ČR (koordinátor Výzkumný ústav rostlinné výroby Praha-Ruzyně)
Služby CCF
- Bezplatné poskytování kultur hub z databáze Národního programu výukovým a výzkumným institucím (viz seznam).
- Poskytování ostatních kultur hub pro výukové a vědeckovýzkumné účely. Kultury jsou poskytovány ve zkumavkách nebo ve formě lyofilizátů.
- Bezpečné uložení kultur mikroskopických hub na určitou dobu.
- Lyofilizace kultur hub.
- Identifikace čistých kultur mikroskopických hub.
- Mykologické rozbory - izolace a identifikace plísní z různých materiálů.
- Molekulární analýza hub.
Ceník 2024
| Kultury hub z databáze Národního programu (nekomerční využití) (seznam) | zdarma* |
| Kultury hub doporučené pro výuku | zdarma* |
| Ostatní kultury mikroskopických hub (nekomerční využití) | 1200 Kč za 1 kmen (sleva 50% pro školy a vědecko výzkumné instituce)* |
| Kultury mikroskopických hub - komerční využití | cena dohodou |
| Bezpečné uložení kultur mikroskopických hub na určitou dobu | 1200 Kč za 1 kmen/rok |
| Lyofilizace kultur hub | 1200 Kč za 1 kmen (10 ampulí) |
| Identifikace čistých i směsných kultur mikroskopických hub | 800-1000 Kč za určení 1 houby |
| Identifikace na základě molekulární analýzy hub | 2200-3000 Kč za určení 1 houby |
* K ceně kultur se připočítává poštovné a balné. Osobní odběr je zdarma.
Ceny jsou uvedeny včetně 21% DPH.
Molekulární analýza hub zahrnuje izolaci DNA z čisté kultury (izolační kit), amplifikace úseku ITS1-5,8S-ITS2 a části 28S rDNA, vizualizace produktů gelovou elektroforézou, purifikace (purifikační kit) a příprava na sekvenování. Sekvenování je prováděno v servisní laboratoři PřF UK v Praze. Získané sekvence jsou manuálně editovány a následně srovnány se sekvencemi v databázi GenBank. Určení do druhu je možné na základě 100% shody s jednou nebo více shodně pojmenovanými sekvencemi daného druhu houby.
Dohoda o poskytování a nakládání s materiálem (MTA) a Příloha k dohodě.
Kontaktní adresa
Sbírka kultur hub (CCF)
Katedra botaniky
Přírodovědecká fakulta
Univerzita Karlova
Benátská 2
128 01 Praha 2
Česká republika
tel. : +420 221 95 1656-7
fax.: +420 221 95 1645
e-mail: kubatova@natur.cuni.cz