Týmy prof. Tomáše Obšila z Katedry fyzikální a makromolekulární chemie Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy, doc. Václava Veverky z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR a Dr. Veroniky Obšilové z Fyziologického ústavu AV ČR objasnily strukturní podstatu interakce klíčových transkripčních faktorů p53 a FOXO4. Studie vyšla v prestižním časopise Nature Communications.
Transkripční faktory a tumorové supresory FOXO4 a p53 regulují stárnutí buněk a jejich deregulace je spojena s řadou onemocnění, včetně rakoviny. Za stresových podmínek dochází k podpoře buněčné senescence díky interakci Forkhead DNA vazebné domény proteinu FOXO4 s transaktivační doménou proteinu p53. Tato interakce způsobuje sekvestraci p53 a zvýšení transkripce proteinu p21, který je regulátorem buněčné senescence. Týmy z katedry fyzikální a makromolekulární chemie PřF UK, Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR a Fyziologického ústavu AV ČR v této nové studii ukázaly, že interakce mezi p53 a FOXO4 jsou vysoce heterogenní. Pomocí metod jaderné magnetické resonance a molekulového modelování vědci ukázali, že transaktivační doména p53 interaguje s N-koncovou oblastí Forkhead domény FOXO4, přičemž v komplexu zůstává značně flexibilní. Studie dále ukázala, že p53 interaguje s FOXO4 různými způsoby, což způsobuje značnou strukturní variabilitu tohoto komplexu.
Struktura jednoho z konformerů komplexu FOXO4-DBD:p53-TAD. Povrch FOXO4-DBD je obarven dle elektrostatického potenciálu. Protein p53-TAD je znázorněn šedě pomocí stužkové reprezentace, oblast TAD2 je zvýrazněna oranžově. Záporně nabité zbytky Glu a Asp p53-TAD jsou zvýrazněny červeně.
Odkaz na práci: Nat. Comm. 2025, 16, 4907. https://www.nature.com/articles/s41467-025-59106-5