E-mail | SIS | Moodle | Helpdesk | Knihovny | cuni.cz | CIS Více

česky | english Přihlášení



RAPD IV. - vyhodnocování dat

1. definujeme si lokusy, které budeme brát jako interpretovatelné

  • s nekolísající intenzitou
  • ty, které se objevili i po nezávislém opakování analýzy

RAPD - hodnocení lokusů

2. přítomnost/absenci proužků přepíšeme do 0-1 matice

RAPD - 0-1 matice

3. binární data vyhodnocujeme standardními způsoby

  • indexy podobnosti (Nei & Li, Jaccard...)
  • shlukovací techniky (UPGMA, NJ...)
  • analýza hlavních koordinát (PCoA)
  • analýzy molekulární variance (AMOVA)
  • ...

Akce dokumentů